Chargé-e de recherche en hétérogénéité cellulaire et métabolisme fongique

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Présentation d'INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche qui réunit 12 000 collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l’ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.

Face à l’augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s’engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l’évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l'unité Mycologie et Sécurité des Aliments (MycSA) du centre INRAE Nouvelle Aquitaine Bordeaux. MycSA met en œuvre une approche intégrative associant microbiologie, biochimie et biologie moléculaire, pour comprendre les événements qui conduisent à la contamination des céréales et produits dérivés par des métabolites fongiques toxiques, les mycotoxines. Le modèle central d'étude ce sont les champignons phytopathogènes du genre Fusarium du fait de leur fréquente occurrence en Europe et des toxicités avérées des mycotoxines produites. 

Vous développerez vos programmes de recherche en interagissant avec tous les membres de notre unité et bénéficierez d'un accès aux plateformes de l'écosystème scientifique bordelais (Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux, Bordeaux Imaging Center, etc.), d'un réseau diversifié de collaborations scientifiques nationales et internationales ainsi que des partenariats socioéconomiques. Nos travaux ont mis en évidence des évènements et mécanismes moléculaires clefs impliqués dans la régulation de la toxinogénèse. Elles ont été obtenues par des approches considérant l'ensemble des cellules constituant un mycélium, sans prendre en compte son hétérogénéité cellulaire résultant de la formation de micro-environnements et d'évènements de différenciation spatio-temporelle. 

Outre l'avantage adaptatif apporté par l'existence de populations de cellules dans des états physiologiques distincts, l'existence de cellules fongiques étant capables, au moins dans un laps de temps spécifique, de produire des mycotoxines, soulève l'hypothèse d'un niveau de régulation du métabolisme secondaire médié par une diversification des cellules productrices. 

Vous étudierez cette hétérogénéité cellulaire pour comprendre les mécanismes conduisant à la production de mycotoxines ainsi que son importance dans l'adaptation des champignons filamenteux à leur environnement. Vous développerez et appliquerez des approches quantitatives en « cellule unique » et analyserez des variations du transcriptome et du métabolome dans des cellules isogéniques. Votre première tâche sera de décrire cette hétérogénéité au sein d'un tissu mycélien complexe. Cela vous permettra d'apporter un nouveau niveau de connaissance des mécanismes de production de mycotoxines et de leur régulation. Vous aurez ainsi l'opportunité de vous positionner rapidement et de façon pérenne sur un front de science stratégique.

Formations et compétences recherchées

Concours ouvert aux candidats titulaires d'un doctorat (ou équivalent). 
Préférentiellement, vous avez suivi une formation ou acquis des expertises en physiologie et /ou en génomique fonctionnelle des champignons, et/ou en génomique appliquée à l'échelle d'une cellule unique. Une expérience en imagerie cellulaire serait un atout supplémentaire pour analyser la dimension spatiale de l'hétérogénéité cellulaire.
La maîtrise de l'anglais est souhaitée ainsi qu'une expérience internationale de longue durée : les lauréats qui n'en auraient pas encore eu devront réaliser un séjour à l'étranger à l'issue de l'année de stage.

Découvrez votre futur poste en vidéo !

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez :

- de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Consultez notre guide pour faciliter la venue et le séjour des scientifiques internationaux à INRAE

Modalités pour postuler

1. Je télécharge le guide Guide des candidats CRCN 2025 pdf - 3.72 MB
2. Je note le numéro du profil CR-2025-SPE-4
3. Je m'inscris Inscription