Chargé-e de recherche en apprentissage automatique et apprentissage profond sur données structurées

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Présentation d'INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche. 

C'est un acteur majeur de la recherche et de l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de recherche finalisé issu de la fusion entre l’Inra et Irstea, INRAE rassemble une communauté de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. 

L’institut se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et se classe 11ème mondial en écologie-environnement. Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

L'unité propre de recherche Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT) est une unité du département Mathématiques, informatique, sciences de la donnée et technologies du numérique (MathNum) d'INRAE. L'unité comporte deux équipes de recherche (SaAB et SCIDyn) et trois plateformes (GENOTOUL Bioinfo, RECORD et SIGENAE). Au sein de ce laboratoire, vous rejoindrez l'équipe Statistique et Algorithmique pour la Biologie (SaAB) composée de dix chercheurs et ingénieurs, une équipe pluri-disciplinaire en informatique/bioinformatique/statistique dont les applications scientifiques sont orientées vers la biologie.

L'équipe a développé des compétences sur le sujet des réseaux de neurones profonds, et plus particulièrement sur des réseaux de neurones capables d'utiliser ou de prédire des informations structurées (par exemple des graphes). L'équipe est aussi porteuse de la chaire "Design using intuition and logic" (DIL) de l'Institut Toulousain d'Intelligence Artificielle (ANITI).

Vous renforcerez la synergie de l’équipe autour du thème central de l’apprentissage et compléterez les compétences déjà présentes sur la thématique de l’apprentissage profond. En votre qualité de chercheur·e spécialiste de ce domaine, vous serez capable de proposer des solutions/architectures originales pour les problèmes d’apprentissage d’objets structurés avec des approches neuronales. L'un des principaux verrous méthodologiques concerne le développement d'hybridations originales entre l'optimisation discrète (pour la recherche de structure) et l'optimisation continue (sur laquelle les réseaux de neurones sont basés). Ces questions sont d'un grand intérêt pour diverses problématiques abordées dans l'équipe : inférence de réseaux de gènes, design de protéines, prédiction de phénotypes, annotation automatique de génomes.

Votre équipe vous en dit plus sur votre futur job

Formations et compétences recherchées

Concours ouvert aux candidats titulaires d’un doctorat (ou équivalent).

Vous êtes titulaire d’un doctorat ou équivalent. Vous avez une expérience de recherche sur les aspects méthodologiques de l’apprentissage (machine et deep learning). Des compétences scientifiques complémentaires orientées vers les réseaux de neurones pour graphes, l’apprentissage d’objets structurés ou les modèles graphiques seraient appréciées.

De même, une connaissance des applications en biologie moléculaire et génomique n’est pas indispensable mais serait un plus.
Vous avez le goût du travail en équipe et un très bon relationnel. Vous faites preuve d’initiative et d’autonomie.

La maîtrise de l’anglais est souhaitée ainsi qu’une expérience internationale de longue durée : les lauréats qui n’en auraient pas encore réalisé seront fortement incités à effectuer un séjour à l’étranger co-construit avec l’équipe d’accueil à l’issue de l’année de stage.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez :

- de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Consultez notre guide pour faciliter la venue et le séjour des scientifiques internationaux à INRAE