Contrôle des interactions biotiques et abiotiques pour l’innovation fromagère : indicateurs et capteurs pour un pilotage intelligent des procédés

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Présentation d'INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche qui réunit 12 000 collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l’ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.

Face à l’augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s’engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l’évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

Contexte et partenariats 
Le projet s’inscrit au cœur de l’un des trois axes différenciant de l’espace Enseignement supérieur et recherche (ESR) de Bourgogne Franche Comté, « Territoires, Environnement, Aliments ». Cet axe rassemble des dispositifs de formation, de recherche et d’innovation qui s’alignent thématiquement et structurellement avec les dispositifs TRANSBIO (Graduate School du PIA 3) et HARMI (Programme ExcellencES du PIA 4). Le projet s’inscrit pleinement dans le cadre du Grand Défi (France 2030) Ferments du Futur dont l’unité mixte de recherche procédés alimentaires et microbiologiques (UMR PAM) est partenaire. L’axe de recherche développé portera sur l’étude des procédés fromagers et s’inscrira dans deux thématiques majeures de l’UMR PAM : le développement de nouveaux produits alimentaires et la maîtrise des fermentations par des procédés biologiques et durables. La plateforme FROMEX et sa minifromagerie expérimentale constitueront un atout majeur pour tester, modéliser et optimiser ces procédés. La fusion des unités de Dijon et Poligny a permis de renforcer ces recherches par une expertise sur les procédés fromagers, complémentaire aux matrices fermentées étudiées (vin, légumes, coproduits). Les outils et méthodologies développés en technologie fromagère, notamment les approches analytiques et les capteurs de suivi de la qualité, pourront être transposés à d’autres fermentations alimentaires. Le lien avec le réseau ACTIA, via l’unité mixte technologique (UMT) CAPPLAI, offrira un cadre partenarial interdisciplinaire favorable au transfert vers la profession laitière et la communauté scientifique. Nature et objet du projet de recherche à développer et activités associées Dans un contexte de transitions environnementales, l’évolution de la composition des laits et la diminution de la diversité microbienne modifient les transformations fromagères et nécessitent un pilotage fondé sur une meilleure compréhension des mécanismes en jeu. Les travaux porteront sur l’étude conjointe des interactions microbiennes (biotiques) et des paramètres abiotiques clés (pH, potentiel redox, nutriments). Ils s’appuieront sur le suivi expérimental de la matrice fromagère et des métabolites issus de l’activité microbienne afin d’identifier des marqueurs pertinents pour développer des capteurs innovants. Ces données alimenteront des approches de modélisation reliant conditions de procédé, dynamiques microbiennes et évolution de la matrice, pour établir des leviers de pilotage. L’objectif final est d’aboutir à un pilotage intelligent des procédés fromagers, combinant l’ajustement des paramètres abiotiques et la sélection de consortia microbiens aux fonctionnalités ciblées. 

Nature et objet du projet d’enseignement 
Le projet d’enseignement sera développé au sein du master international MP2 (2h CM + 2h TD), ainsi que dans deux dominantes de la formation initiale d’ingénieur de l’Institut Agro Dijon (4h CM). L’objectif sera d’apporter une vision claire du rôle des procédés dans le pilotage des consortia microbiens. La plateforme FROMEX à Poligny offrira un cadre privilégié à la réalisation de travaux expérimentaux sur la matrice fromagère (16h TP). Les projets tutorés et les suivis de stages (16h TD) devraient faciliter la poursuite en thèse. Ces formations sont associées à des Graduate School et fortement soutenues par le projet national d’excellence HARMI (Harnessing Microbiomes for Sustainable Development), porté initialement par l’Université de Bourgogne-Franche-Comté (14 M€ 2024-34). Un des piliers du programme est de développer le lien recherche-formation, en s’appuyant sur les parcours de formation par et à la recherche, proposés par la Graduate School territoires-environnement-aliments. 

Financement et moyens associés
Package ANR : 200 000€ 
Package INRAE : 222 000€ 
Autres financement : 155 000€ 
Total : 577 000€

Le poste est basé à Poligny avec des déplacements fréquents sur le site dijonnais. Interactions indispensables avec l'ensemble des interlocuteurs de l’UMR.

Formations et compétences recherchées

La personne recrutée sera titulaire d’un doctorat en sciences et technologies des aliments ou dans une discipline connexe (génie des procédés, microbiologie), avec une expertise en fermentations alimentaires et idéalement en procédés fromagers. Dans le cas contraire, la personne suivra une formation en technologie fromagère dès son recrutement. Elle devra démontrer une production scientifique de niveau international sur cette thématique. Une solide expertise en analyse et caractérisation des procédés fermentaires, en microbiologie des matrices fermentées ainsi qu’en étude des interactions entre paramètres physico-chimiques et communautés microbiennes des procédés est attendue. Des compétences en modélisation des procédés biologiques et en outils de suivi ou de pilotage des fermentations font également partie du profil recherché ; une expérience dans l’utilisation et/ou le développement de capteurs constituera un atout. L'autonomie dans la rédaction et le portage de projets, l'aptitude à l'encadrement et la capacité à instaurer des collaborations intra et inter équipe sont également requises.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez :

- de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Consultez notre guide pour faciliter la venue et le séjour des scientifiques internationaux à INRAE

Nature du contrat

Les chaires de professeur junior permettent de recruter des scientifiques sur projet de recherche et d’enseignement pendant une durée de 3 ans. Puis, à l’issue de cette période et après évaluation de votre valeur scientifique et de votre aptitude professionnelle, vous pouvez accéder à un emploi de titulaire dans le corps des directeurs et directrices de recherche de 2e classe (DR2).

Une convention de recherche et d’enseignement précisera le parcours de titularisation que vous suivrez afin de vous permettre d'acquérir une qualification en rapport avec les missions du corps dans lequel vous avez vocation à être titularisé-e.

Les inscriptions sont ouvertes jusqu'au 22 juin 2026. Seuls seront convoqués à l’audition les candidats et les candidates préalablement sélectionné-es sur dossier par la commission de sélection.

Modalités pour postuler

1. Je télécharge le guide Guide des candidats pdf - 4.07 Mo
2. Je note le n° du profil CPJ26-TRANSFORM-1
3. Je postule Espace d'inscription