Technicien-ne en virologie des plantes

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Présentation d'INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche. 

C'est un acteur majeur de la recherche et de l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de recherche finalisé issu de la fusion entre l’Inra et Irstea, INRAE rassemble une communauté de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. 

L’institut se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et se classe 11ème mondial en écologie-environnement. Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Sur le Centre INRAE Grand Est-Colmar, l'unité mixte de recherche Santé de la vigne et qualité du vin (UMR SVQV) associant des personnels permanents d'INRAE, de l'Université de Strasbourg et de l'Université de Haute Alsace, conduit des recherches sur les maladies fongiques et virales de la vigne. Grâce à la compréhension des interactions entre la vigne et ses bioagresseurs, les chercheurs peuvent proposer des solutions durables répondant aux enjeux d'une viticulture respectueuse de l'environnement. Au sein de cette UMR, l'équipe Virologie et Vection (ViVe), composée de 22 permanents et 13 contractuels, étudie les viroses et leur dispersion par vecteurs. Les activités de l'équipe s'étendent de la biologie des virus aux interactions hôtes-virus-vecteurs, connaissances fondamentales exploitées pour élaborer des stratégies de luttes antivirales et antivectorielles innovantes. Nous développons notamment une méthode de biocontrôle pour lutter contre le court-noué de la vigne - une maladie virale, transmise par un nématode du sol. Cette méthode appelée prémunition consiste à inoculer un variant viral sélectionné pour sa faible pathogénicité pour protéger les vignes d'une infection ultérieure par les virus apparentés responsables des formes sévères de la maladie. Pour l'ensemble de ces travaux, une collection de virus de vigne constamment enrichie, constitue une ressource biologique cruciale pour tous les projets de recherche de l'équipe.
Vous travaillerez au sein de l'équipe ViVe, en interaction avec les personnes d'INRAE (UMR SVQV et Unité d'Expérimentation Agronomique et Viticole), de l'IFV (Institut Français de la Vigne et du Vin), du laboratoire partenarial associé "Vitivirobiome" (LPA-INRAE/IFV), sous la supervision d'une ingénieure de recherche et en appui à une chargée de recherche récemment recrutée pour étudier les mécanismes de la prémunition.
Plus précisément vous serez en charge :
- de conserver et développer la collection de virus de la vigne (vignes en parcelle, en serre et inoculums à -80°C) avec sa caractérisation (vérification de la composition en virus et variants viraux par analyses de séquences) ;
- d'assurer le bon maintien de cette collection en termes d'assurance qualité et traçabilité (cahier de laboratoire, rédaction et actualisation des protocoles, suivi des analyses) ;
- de produire du matériel virosé en utilisant les techniques classiques de virologie (inoculations, purifications), de culture in vitro (greffage hétérologue, multiplication de vitroplants primo-infectés), de serre (greffes et boutures), et de vérifier ces infections virales par des techniques de sérologie et de biologie moléculaire ;
- d'assurer la logistique pour la mise en place et le suivi des expérimentations au vignoble (notations de symptômes, prélèvements, gestion des échantillons et des données) ;
- de contribuer à l'élaboration d'Outils d'Aide à la Décision pour la sélection des variants viraux les plus prometteurs pour la prémunition ;
- de participer à la mise en forme et à l'analyse des données avec leur présentation ainsi qu'à la formation de stagiaires et CDD.

Poste ouvert uniquement aux fonctionnaires et aux agents en CDI de la Fonction Publique.
Des déplacements au vignoble sont prévus, le permis B est fortement recommandé pour le poste.

Formations et compétences recherchées

Une formation en biologie avec un intérêt pour la phytopathologie, la virologie, et des connaissances sur les méthodes de diagnostic des maladies des plantes seront recherchées.
Des aptitudes pour le travail au vignoble, en serre, en culture in vitro et aux laboratoires de sérologie et biologie moléculaire seront les bienvenues sur des projets à la fois fondamentaux et appliqués.
Rigueur, capacité de travail en équipe, qualités relationnelles et sens de l'organisation seront appréciées.
Maîtrise recommandée des logiciels informatiques et bio-informatiques (Office, logiciels d'analyses de séquences) pour la mise en forme, l'analyse des données et la traçabilité des résultats.