Thèse : MODELSYLVA - Développement et évaluation d'un système de simulation des systèmes sylvopastoraux

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli.e au sein de l'Unité Mixte de Recherche sur l'Écosystème Prairial (UREP). Située à Clermont-Ferrand, dans le Puy-de-Dôme, l’Unité de Recherche sur l’Écosystème Prairial (UREP) étudie l’agroécologie des prairies dans un contexte de changement global, notamment les évolutions climatiques et les pratiques de gestion. L'Unité possède une expertise internationale dans les domaines suivants : les cycles du carbone et de l'azote (incluant le bilan de gaz à effet de serre et la séquestration de carbone), l’assemblage des communautés végétales, les interactions biotiques (plante-sol-animal) et leurs conséquences sur le fonctionnement des prairies. L'Unité est rattachée au Département Écologie et biodiversité des milieux forestiers, prairiaux et aquatiques (ECODIV) de l’Institut National de Recherche pour l’Agronomie, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE).

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Concevoir et implémenter un modèle informatique simulant les interactions complexes dans les systèmes sylvopastoraux (arbres, prairies, bétail)
• Adapter des modèles existants et intégrer de nouvelles fonctions (impact du pâturage, variations climatiques, dynamiques socio-économiques)
• Utiliser des données de terrain (microclimat, comportement animal, qualité de l’herbe) pour calibrer et valider le modèle
• Évaluer différents scénarios de gestion (ex. intensité de pâturage, régénération forestière) afin d’optimiser la durabilité des systèmes
• Réaliser des analyses de sensibilité pour identifier les facteurs clés influençant la résilience des écosystèmes
• Rédiger des articles scientifiques pour des revues internationales
• Présenter les travaux lors de conférences nationales et internationales
• Contribuer à la diffusion des outils développés (logiciels en accès libre, documentation technique)

Autonomie et rigueur scientifique : Le travail se fera de manière autonome, avec une forte exigence de rigueur méthodologique (validation des hypothèses, reproductibilité des résultats). Une bonne gestion du temps sera essentielle afin de respect les échéances du plan de thèse (revue bibliographique, développement, validation, publications). Une documentation claire du code et des protocoles garantira la transparence et la réutilisabilité des outils développés.

Esprit d'équipe et communication : La modélisation écologique se fera en étroite collaboration avec des chercheurs en écologie et agronomie (UREP, UMR Herbivores, UMR PIAF) pour l’intégration des données biologiques, des ingénieurs en informatique (mésocentre Clermont-Auvergne) pour l’optimisation des calculs haute performance, ainsi que des partenaires internationaux (ex. Afrique du Sud) pour adapter le modèle à différents contextes. Cette collaboration impliquera également une participation active aux réunions d’équipe, aux séminaires et aux ateliers pluridisciplinaires.

Apprentissage continu : Dans un domaine évoluant rapidement, il est essentiel de suivre les avancées en modélisation écologique et agroforestière (veille bibliographique), d’adapter ses compétences aux nouvelles méthodes (ex. intelligence artificielle appliquée à l’écologie, approches spatialisées) et de participer à des formations organisées par INRAE ou ses partenaires sur des outils spécifiques (ex. Git, calcul parallèle).

• Travail sur ordinateur : La majorité des tâches sera réalisée sur ordinateur, incluant la programmation pour le développement et l’optimisation du modèle, l’analyse de données climatiques, biologiques et pastorales, la visualisation scientifique et l’utilisation de logiciels de modélisation environnementale.
• Conditions de travail variées : En complément du travail de bureau, des missions de terrain pourront être nécessaires afin de collecter des données et de valider les hypothèses du modèle.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée :

• Master 2 (Recherche) en écologie/agroécologie, agronomie/sciences de l’environnement, modélisation mathématique ou informatique appliquée aux sciences du vivant
• Diplôme d'ingénieur en agronomie, environnement ou data science

Connaissances souhaitées :

• Écologie et agronomie : fonctionnement des écosystèmes prairiaux et sylvopastoraux ; interactions plantes-sol-animal (biodiversité, cycles biogéochimiques)
• Modélisation et informatique : maîtrise avancée de Java et/ou R (obligatoire), expérience avec des outils de modélisation, bonnes pratiques en développement logiciel (Git, tests unitaires, documentation)
• Analyse de données : statistiques et visualisation scientifique

Expérience appréciée :

• Stage/mémoire en modélisation écologique (ex. dynamique des populations)
• Utilisation de données terrain (microclimat, suivi pastoral, télédétection)
• Communication scientifique : rédaction d’articles ou rapports techniques, présentations en colloques ou ateliers, expérience en agroforesterie ou gestion des pâturages, collaboration avec des équipes pluridisciplinaires

Aptitudes recherchées :

• Capacité d'analyse critique et de synthèse
• Esprit d'initiative et autonomie
• Rigueur scientifique et souci du détail
• Aptitude au travail en équipe et à la collaboration
• Excellentes compétences en communication écrite et orale
• Maîtrise de l'anglais

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Le site de Crouël est directement desservi par les lignes de bus régulières T2C n°9, n°35 et n°36.

 

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation