Ingénieur d’étude en microbiologie et biologie moléculaire

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli (e) au sein de l’équipe des Interactions des Microorganismes Commensaux et Probiotiques avec l’Hôte (acronyme ProbiHôte), dans l’Institut MICALIS du centre INRAE de Jouy-en-Josas/Antony. Vous serez amené à concourir dans le cadre d’un projet financé par INRAE. L’objectif de ce projet est de cribler et de sélectionner une nouvelle classe de peptides antimicrobiens, les STAMP (pour Selective-Target Antimicrobial Peptides), contre des pathogènes résistants aux antibiotiques classiques. Nous nous concentrerons en particulier sur les bactéries du groupe ESKAPE (pour Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, and Enterobacter spp.)

Attention, l’Institut MICALIS est un établissement sous statut Zone à Régime Restrictif (ZRR). Ceci peut entraîner des délais importants dans la constitution des dossiers de recrutement. Le projet et le candidat devront être approuvés par le SGDSN (Secrétariat Général de la Défense et de la Sécurité Nationale) et pourront donner lieu à un refus non motivé.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Test de sensibilité in vitro d'une série de peptides STAMPS synthétiques contre les bactéries du groupe ESKAPE afin de déterminer la concentration minimale inhibitrice (CMI) et de sélectionner les plus pertinents et les plus prometteurs pour les cloner dans différentes bactéries probiotiques en tant que vecteurs d'expression.
• La réalisation de clonages dans la souche probiotique Gram négatif d'Escherichia coli Nissle 1917 et dans deux bactéries lactiques modèles (LAB) : Lactococcus lactis et Lactiplantibacillus plantarum
• La mise en œuvre et/ou le développement de techniques de biologie moléculaires nécessaires à la réalisation de ces clonages
• D’évaluer la capacité des bactéries génétiquement modifiées à produire des STAMPs par Western blot ou de façon indirect en réalisant des essais d'activité antimicrobienne contre les bactéries ESKAPE dans des essais in vitro.
• D’effectuer des recherches bibliographiques pour améliorer certaines méthodologies pertinentes pour le projet, en parallèle d'une veille bibliographique régulière sur la thématique.
• En concertation avec vos encadrants, de planifier les essais, réaliser les analyses, les exploiter et les présenter lors de réunions où vous serez également force de proposition.
• D’intégrer les résultats obtenus dans un rapport scientifique final.

L'unité est une Zone à Regime Restrictif le recrutement est donc soumis à validation par le ministère. 

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : M2 en microbiologie et biologie moléculaire

Connaissances souhaitées : microbiologie générale, biologie moléculaire (techniques de clonage bactériens), biochimie (Western blots, Elisa) et biologie cellulaire

Expérience appréciée : expérience souhaitée en construction de souches bactériennes recombinantes à partir de souches de bactéries lactiques.

Aptitudes recherchées :

• Fiabilité
• Minutie technique et rigueur
• Capacité à produire des résultats et à fournir un retour oral et écrit sur ceux-ci
• Enthousiasme et bonne écoute

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation