Assistant.e ingénieur.e en séquençage d’ADN métagénomique

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

¡ Vous serez accueilli.e au sein de l’unité MétaGénoPolis (MGP) qui propose des technologies performantes à haut débit pour analyser la diversité des microbiotes complexes et des interactions entre les bactéries intestinales et les cellules humaines. Son objectif premier est d’explorer le lien entre le microbiote, la nutrition et la santé. MetaGenoPolis est également au cœur du projet « Le French Gut », qui a pour ambition de cartographier et mieux comprendre l’hétérogénéité des microbiotes intestinaux sains français, les facteurs environnementaux et modes de vie les impactant, ainsi que leurs déviations dans les maladies chroniques (cancers, Alzheimer, Parkinson, troubles du spectre autistique, diabète, obésité, maladie de Crohn,….). Les projets sont réalisés en étroite collaboration avec des partenaires industriels, des équipes de recherche et des centres cliniques.

MGP comprend 4 plateformes apportant chacune une expertise spécifique dans le cadre d’approches de métagénomique quantitative ou fonctionnelle.

Vous interviendrez sur la plateforme de séquençage d’ADN MetaQuant, sous la responsabilité directe de ses responsables opérationnels. Cette plateforme est équipée de robots de préparation d’échantillons, d’automates d’analyses et d’appareils de séquençage d’ADN nouvelle génération à haut débit.

¡Vous serez plus particulièrement en charge :

• du contrôle qualité des échantillons d’ADN dès leur réception dans la plateforme et tout au long du processus
• de la construction de bibliothèques métagénomiques à partir de ces échantillons
• du séquençage à haut débit d'échantillons d'ADN
• du suivi des stocks de consommables de la plateforme
• de l’entretien et la maintenance de premier niveau des équipements

¡Vous serez amené.e également à :

• consigner, mettre en forme et présenter les résultats
• participer à la rédaction et l’actualisation des protocoles techniques
• participer au développement technologique de la plateforme
• participer à la mise en œuvre de nouveaux équipements dans le cadre du projet « Le French Gut »
• participer à l’implémentation d’un système de gestion de l’information de laboratoire (LIMS)
• participer, au niveau de la plateforme, au maintien de la démarche qualité et de sécurité de l’information en place dans l’Unité certifiée ISO 9001 et ISO27001
• appliquer les règles d’hygiène, de sécurité et environnementales dans les activités de la plateforme 

Automatisation des étapes du processus de traitement des échantillons nécessitant le travail sur des robots de pipetage.

Formations et compétences recherchées

Niveau Formation : Bac+2 ou Bac+3 maximum en biotechnologies ou biologie

Connaissances souhaitées : Connaissances des techniques standards de biologie moléculaire, connaissance basique d’Excel

Compétences appréciées : Utilisation d’appareils d’analyse et d’expérimentation en biologie

Aptitudes recherchées : Rigueur, sens de l’organisation, sens critique

Expérience : Débutant.e.s accepté.e.s

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation