Doctorat en biologie du développement des plantes : coordination de la polarité cellulaire et de la division dans un méristème de tige simple

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein du laboratoire RDP (Reproduction et Développement des Plantes). Le RDP est une unité mixte de recherche multi-tutelles (CNRS, INRAE, ENS de Lyon, UCBL, et associée à l’INRIA) composée de 8 équipes de recherche (environ 130 personnes). Le laboratoire est situé sur le site Monod de l'ENS de Lyon (https://www.ens-lyon.fr/RDP/?lang=eng). Le doctorat financé pour une durée de 3 ans (début au 1er octobre 2025) se positionne dans le cadre d’un projet collaboratif entre le Laboratoire de Reproduction et Développement des Plantes (ENS Lyon, France), le Laboratoire de Biochimie de l’Université de Wageningen (WUR, Pays-Bas) et l’Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB, INRAE Versailles, France). L’étudiant·e sera basé·e à l’ENS de Lyon et travaillera sous la direction du Dr Yoan COUDERT (équipe SIGNAL). Il/elle/iel sera co-encadré·e par le Pr Dolf WEIJERS (WUR) et le Dr Philippe ANDREY (INRAE Versailles). Des séjours à Wageningen Versailles sont prévus selon l’avancement du projet.

Sujet de recherche : La polarité cellulaire est essentielle pour la croissance et l’organisation des organismes multicellulaires. Bien que largement étudiée chez les animaux, notamment dans la régulation des divisions cellulaires asymétriques et la ségrégation des destins cellulaires, son rôle dans le développement des plantes reste largement inexploré. En particulier, le lien entre polarité cellulaire et division asymétrique dans les méristèmes végétaux reste mal compris (Véron et al., Trends Plant Sci 2021). Cela s’explique notamment par la complexité des patrons de division cellulaire dans les niches de cellules souches des angiospermes et une connaissance encore limitée de l’établissement de la polarité au niveau moléculaire. Toutefois, cela commence à changer avec la découverte récente des protéines SOSEKI (SOK) qui présentent des homologies structurelles et fonctionnelles avec des régulateurs de la polarité chez les animaux. Les SOK sont des cibles de l’auxine, conservées chez les plantes terrestres, et présentent des motifs de distribution polaire spécifiques aux tissus (Yoshida et al., Nat Plants 2019 ; van Dop et al., Cell 2020). Cependant, leur rôle développemental reste à élucider.

Objectif de recherche : Ce projet exploite la simplicité du méristème apical de tige de la mousse Physcomitrium patens pour comprendre les relations complexes entre polarité cellulaire, orientation des divisions et architecture caulinaire. Des expériences préliminaires ont montré que les protéines SOK sont essentielles à l’établissement du méristème de Physcomitrium et à la production des organes latéraux, mais les mécanismes cellulaires sous-jacents restent inconnus. Dans ce projet, nous explorerons les mécanismes cellulaires et moléculaires par lesquels les protéines SOK coordonnent dynamiquement la polarité cellulaire et la division dans un méristème végétal simple afin de produire une architecture de tige robuste.

Formations et compétences recherchées

• Connaissances souhaitées : Fort intérêt pour la biologie du développement des plantes, connaissances
  générales en biologie du développement, cellulaire et moléculaire
• Expérience appréciée : Phénotypage d’organismes vivants à l’échelle cellulaire, biologie moléculaire et
  biochimie (PCR, clonage), culture de cellules et tissus in vitro, microscopie confocale et analyse d’image
• Aptitudes recherchées : Candidat·e motivé·e, fortement impliqué·e dans son projet de recherche et
  capable de résoudre des problèmes scientifiques, de discuter de manière critique les résultats
  expérimentaux et d’interagir avec des scientifiques de différents horizons. A noter que les langues de
  travail du laboratoire et de l’institut sont le français et l’anglais. D’excellentes compétences rédactionnelles
  et de communication sont requises.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Transmettre une lettre de motivation, un CV et les noms et coordonnées de deux personnes référentes à : Yoan COUDERT : yoan.coudert@ens-lyon.fr

Vous pouvez écrire directement à Yoan COUDERT pour toute question sur le projet proposé