Post-doc : Estimation de la sévérité et de la propagation du jaunissement de la betterave à partir de séries temporelles d’images satellitaires.

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Ce poste s'inscrit dans le cadre du projet BEET-SAT (PNRI-C), situé au laboratoire DYNAFOR, en collaboration avec BioSP (UR INRAE).

Ce post-doctorat en télédétection vise à détecter et suivre la propagation du jaunissement de la betterave au fil du temps à l'échelle des parcelles et intra-parcellaire à l’aide de différentes séries temporelles d’images satellitaires (SITS). Le travail se décompose en trois étapes principales :

• Comprendre le comportement spectral de la betterave au cours d’une saison de croissance et sur plusieurs années, en se basant sur les indices spectraux de Sentinel-2 qui mettent en évidence le contenu en pigments foliaires, la structure des feuilles et la teneur en eau, tous ces éléments étant censés réagir aux symptômes des virus responsables du jaunissement de la betterave. Le stress hydrique provoque également des symptômes similaires sur les betteraves, et il sera important de dissocier ces deux causes afin de constituer une base de données fiable.
• Évaluer l’impact de la résolution spatiale des SITS sur la détection et la différenciation du stress et de la maladie. Dans un premier temps, les séries temporelles natives de Sentinel-2 seront comparées à une version super-résolue à 5 m, basée sur l’architecture SISR (Lac et al. 2023) et le jeu de données SEN2VENµS (Michel et al. 2022). Cette évaluation sera réalisée sur deux ans et, si les résultats sont positifs,
• des séries temporelles seront générées pour la période 2017-2026. Par la suite, d’autres capteurs comme la constellation PlanetScope (environ 3 m) et Pléiades NEO (30 cm) seront testés. Les résultats seront comparés à plusieurs acquisitions complémentaires issues de technologies de drones (UAV).
• Étudier l’intérêt de combiner les observations satellitaires avec des sorties de simulation estimant l’évapotranspiration et le bilan hydrique des cultures.

Formations et compétences recherchées

Doctorat ou équivalent

• Doctorat en télédétection, science des données ou traitement d’images.
• Des compétences en modélisation mécaniste conceptuelle et spatiale sont souhaitées, et une connaissance en agronomie serait également appréciée.
• Une solide expérience en programmation Python et une bonne maîtrise des bibliothèques de machine learning telles que scikit-learn.
• Bonnes aptitudes relationnelles et ouverture à la multidisciplinarité.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation