Assistant ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques en NGS Short Reads

Retour à la liste des résultats

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité dans l'unité Get-PlaGe sur le centre Occitanie-Toulouse à Auzeville. GeT-PlaGe est une plateforme technologique de séquençage, composée de 23 personnes. Elle propose ses services en Génomique à l'ensemble de la communauté scientifique nationale en agronomie, environnement et écologie.

L'unité GeT-PlaGe a fait le choix depuis plusieurs années de se positionner sur des technologies de pointe. Ainsi, les technologies et méthodologies développées sont parmi les premières disponibles en France dans le domaine. Pour répondre à l'ensemble des besoins des partenaires scientifiques avec lesquels nous collaborons l'unité GeT-PlaGe propose plusieurs accompagnements qui vont de la réalisation complète des travaux de séquençage (de la matrice ADN/ARN jusqu'au rendu des données de séquençage) à la formation des biologistes afin qu'ils puissent travailler en autonomie sur les équipements proposés par l'unité.

Votre mission principale sera d'adapter et de mettre en œuvre les technologies spécifiques d'une approche méthodologique de la biologie dans le cadre des technologies de séquençage Short Reads.

Au sein de l'unité, vous serez en charge d'assurer la réalisation des travaux de séquençage pour les équipes de recherche (extraction, contrôle qualité des échantillons, préparation des librairies et lancement des runs de séquençage) et de les accompagner dans le cadre de leurs projets. Les protocoles utilisés contribuent aux études Short Reads WGS, RNAseq quantitatif, EmSeq et potentiellement HiC. A terme, vous assurerez la formation des biologistes internes à l'unité pour ces mêmes protocoles de séquençage.

Vous serez également amené-e à former des utilisateurs pour leur permettre l'utilisation des équipements mis à disposition dans le cadre des projets en autonomie. 

Vous aurez enfin des missions plus transverses comme la maintenance ou la gestion de matériel, la gestion du pole qPCR de GeT-PlaGe, la gestion de certains stocks, et des missions liées à la Qualité et la communication.

Formations et compétences recherchées

Vous êtes titulaire à minima d'un BAC+2 dans le domaine de la biologie. Une expérience sur une plateforme en séquençage à haut débit est souhaitée. Des connaissances générales en biologie moléculaire et génomique sont attendues ainsi qu’une connaissance et une maitrise de la mise en œuvre générale des techniques de séquençage courts fragments. Il est souhaité de connaître le principe et si possible de maîtriser l'utilisation des appareils spécialisés du domaine ; savoir utiliser l'outil informatique pour le traitement et la gestion des données. Vous connaissez les risques et savez appliquer les règles d'hygiène et de sécurité relatives au domaine d'activité. Vous avez un sens aigu de l'organisation, de la rigueur et de la méthode, ainsi qu'une aptitude au travail en équipe, à la communication et à la pédagogie

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation