Stage OT-23038
STAGE M2 ou ingénieur : Adaptation de ModVege-CoSMo pour la simulation spatialisée de pâturages africains
63000 Clermont-Ferrand
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Présentation INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Environnement de travail, missions et activités
VOTRE MISSION ET VOS ACTIVITÉS
Vous serez accueilli(e) au sein de :
Unité Mixte de Recherche sur l’Écosystème Prairial
Centre INRAE Clermont-Auvergne-Rhône-Alpes 5 chemin de Beaulieu 63000 Clermont-Ferrand
Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Concevoir et coder le modèle de spatialisation des pâturages, en intégrant les données météorologiques et phénologiques pertinentes pour simuler les dynamiques des prairies africaines
- Créer des simulations spatialisées pour tester l'impact de différentes pratiques de pâturage (comme l'intensité et la rotation) sur la biomasse et la biodiversité
- Concevoir et implémenter une interface utilisateur interactive permettant aux utilisateurs d’explorer les résultats des simulations et d'obtenir des visualisations claires des données
- Rédiger la documentation technique d'utilisation de l'outil, et présenter les résultats et les avancées du projet lors de réunions avec les partenaires et les équipes de recherche
Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet « PAM-AgroAfrique - Pâturages Africains et Modélisation pour une AGROécologie durable en AFRIQUE » (2024-2025). Soutenu par l'initiative TSARA (« Transformer les systèmes alimentaires et l’agriculture par la recherche en partenariat avec l’Afrique », https://www.inrae.fr/actualites/linitiative-tsara-confirme-sa-dynamique-recherche-dinnovations-partenariat-transition-agricole-alimentaire-afrique) et impliquant des partenaires clés tels que l’INRAE (UREP), le CIRAD (AMAP, SELMET, SENS), ainsi que diverses institutions au Maroc, au Sénégal et en Afrique du Sud (https://www.cirad.fr/dans-le-monde/nos-directions-regionales/afrique-de-l-ouest-zone-seche/actualites/communique-de-presse), ce projet explore les possibilités et les limites d’utilisation des approches de modélisation dans le cadre des contextes particuliers des pâturages africains. Le modèle ModVege, développé à INRAE, permet de décrire les processus de croissance de la végétation en lien avec la météorologie et les pratiques de gestion des prairies. Les abondances relatives des espèces végétales peuvent être évaluées de leur côté via un modèle dédié appelé CoSMo. Ces deux modèles ont été utilisés en France et ont montré leur intérêt pour améliorer la gestion durable des prairies, optimiser les pratiques agricoles et préserver la biodiversité. Le modèle combiné ModVege-CoSMo permettrait également de comprendre et prédire en même temps les variations de production et de biodiversité végétale dans des écosystèmes prairiaux variés. En Afrique, les prairies sont souvent soumises à des cycles annuels courts, des variations saisonnières importantes et une dominance d'espèces végétales annuelles. Ces caractéristiques rendent la gestion des pâturages particulièrement complexe, car elles influencent la dynamique de croissance de la végétation, la disponibilité des ressources alimentaires pour le bétail, et la durabilité des écosystèmes. Ce stage vise à développer un outil informatique capable de spatialiser ces données et d'analyser les effets des pratiques de pâturage, en adaptant un modèle de simulation existant pour mieux représenter ces spécificités.
Le stagiaire devra créer une version de ModVege-CoSMo permettant de spatialiser les zones de pâturage sur une grille de pixels représentant différentes unités de gestion des prairies. Le stagiaire traduira les avancées d’un deuxième stage conduit en parallèle, en intégrant les résultats de la phénologie, des saisons de croissance et des dynamiques de mortalité de biomasse dans le modèle de pâturage. Le stagiaire évaluera également comment différentes pratiques de pâturage influencent la biomasse, la biodiversité et la durabilité des écosystèmes, en utilisant des simulations pour tester divers scénarios. Enfin, le stagiaire mettra en place une interface de visualisation interactive permettant de visualiser les résultats des simulations de pâturage, facilitant ainsi la compréhension des dynamiques écologiques et l’impact des pratiques de gestion.
Pour atteindre ces objectifs, le stagiaire :
- traduira les modèles écologiques en code, en utilisant le langage JAVA pour créer les algorithmes de spatialisation et d’analyse ;
- simulera différentes pratiques de pâturage (intensité, rotation, durée) et observera leur impact sur la biomasse et la biodiversité au sein de la grille ;
- développera une interface utilisateur interactive pour visualiser les résultats des simulations et permettre aux utilisateurs d’explorer différents scénarios ;
- testera l’outil développé en s’assurant de sa robustesse et de son efficacité.
Pour cela, le stagiaire collaborera étroitement avec les chercheurs et ingénieurs de l'UREP et du CIRAD, ainsi qu’avec les partenaires africains. Cette expérience collaborative offrira au stagiaire une vue d'ensemble de la modélisation prairiale et l'occasion de contribuer activement à un projet dont la pertinence s'étend à l'échelle africaine. Les résultats de ce travail pourront, à terme, servir de support à améliorer la gestion durable des pâturages, d’optimiser les pratiques agricoles et préserver la biodiversité en Afrique.
Calanca, P., Deléglise, E., Martin, R., Carrère, P., Mosimann, E., 2016. Testing the ability of a simple grassland model to simulate the seasonal effects of drought on herbage growth. Field Crops Research 187:12-23. https://doi.org/10.1016/j.fcr.2015.12.008
Confalonieri, R., 2014. CoSMo: A simple approach for reproducing plant community dynamics using a single instance of generic crop simulators. Ecological Modelling 286:1–10. https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2014.04.019
Piseddu, F., Martin, R., Movedi, E., Louault, F., Confalonieri, R., Bellocchi, G., 2022. Simulation of multi-species plant communities in perturbed and nutrient-limited grasslands: development of the growth model ModVege. Agronomy 12:2468. https://doi.org/10.3390/agronomy12102468
Mise à disposition d'un bureau équipé d'un ordinateur, d'un accès à internet et d'un environnement informatique pour le codage et les simulations Restauration sur place à tarif préférentiel, prise en charge de 50% du transport
Formations et compétences recherchées
Formation recommandée : Informatique, génie logiciel ou modélisation écologique avec une forte compétence de développement informatique
Connaissances requises : Algorithmique, Développement orienté objet, idéalement en JAVA
Connaissances souhaitées : Connaissance des dynamiques de pâturage et de la phénologie des espèces végétales ; familiarité avec les outils de visualisation de données et les bibliothèques graphiques, langage R
Aptitudes recherchées : Capacité à analyser des données complexes et à interpréter les résultats ; aptitude à développer des solutions créatives aux défis techniques ; capacité à travailler de manière indépendante tout en montrant initiative et motivation ; bonnes compétences interpersonnelles pour collaborer efficacement avec des chercheurs et des ingénieurs ; ouverture à l’apprentissage de nouvelles technologies et méthodologies en cours de projet
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.
Modalités pour postuler
J'envoie mon CV et ma lettre de motivation
Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr