Ingénieur-e de recherche en microbiologie et biochimie

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’Institut MICALIS (Microbiologie de l'Alimentation au service de la Santé), une Unité Mixte de Recherche associant INRAE, AgroParisTech et l’Université Paris-Saclay située à Jouy-en-Josas (78). Vous exercerez votre activité dans l’équipe Paroi (Bacterial Cell Wall Dynamics) (https://www.micalis.fr/equipe/paroi/). Les travaux de l’équipe visent à déchiffrer l’assemblage, les variations structurales et la fonction des composants de la paroi chez différentes espèces de bactéries à Gram positif. Vous travaillerez dans le cadre d’un projet axé sur les mécanismes de résistance aux antibiotiques de la famille des β-lactamines chez la bactérie pathogène Clostridioides difficile. Ces antibiotiques ont pour cible la synthèse du peptidoglycane, composant essentiel de la paroi bactérienne. L’objectif du projet est d’étudier l’impact des enzymes de remodelage du peptidoglycane sur la résistance aux antibiotiques et au stress chez C. difficile. Plus spécifiquement, vous serez impliqué(e) dans la caractérisation d’endopeptidases qui coupent le peptidoglycane et peuvent moduler sa structure, et dans l’analyse de la structure du peptidoglycane de mutants générés dans le projet. Ce projet financé par l’ANR sera mené en étroite collaboration avec deux autres partenaires.

¡Vous serez plus particulièrement en charge de :

- Construire des souches recombinantes pour exprimer les enzymes sélectionnées

- Purifier les protéines par chromatographie FPLC (affinité, gel filtration) et réaliser une caractérisation biochimique

- Analyser la structure du peptidoglycane par des techniques de chromatographie en phase liquide UHPLC et UHPLC couplée à la spectrométrie de masse haute résolution (UHPLC-HRMS).

- Traiter les données de MS avec des outils bioinformatiques

- Synthétiser et présenter les résultats lors des réunions du projet

- Participer à la valorisation des résultats (posters, rédaction d’articles).

Conditions particulières d’activité : L’équipe est constituée de 4 permanents (2 directeurs de recherche, 1 assistant-ingénieur, 1 technicien). Travail en laboratoire L1. 

L’unité Micalis est une Zone à Régime Restrictif. Le recrutement est donc soumis à validation du ministère. 

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Doctorat en microbiologie ou biochimie/Diplôme d’ingénieur avec une spécialité biochimie ou biotechnologie

Connaissances souhaitées : biochimie des protéines, techniques chromatographiques.

Expérience appréciée : production et purification de protéines recombinantes, analyses en LC-MS

Aptitudes recherchées :

- Capacité à travailler en équipe et en collaboration

- Capacité à travailler en autonomie et à gérer un projet.

- Rigueur, capacité d’organisation.

- Capacité à synthétiser ses résultats et les présenter en réunion de projet.

- Mise en forme des résultats obtenus et rédaction d’articles

- Maîtrise de l’anglais technique et scientifique.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation