Apprentissage OT-22053
BUT Informatique (3e année)
31326 Castanet-Tolosan
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Présentation INRAE
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
Environnement de travail, missions et activités
Le Laboratoire des Interactions Plantes-Microbes Environnement (LIPME), est une Unité Mixte de Recherche INRAE-CNRS (180 personnes). Les recherches développées concernent principalement l'étude de la réponse des plantes à leur environnement, et plus particulièrement des interactions symbiotiques et pathogènes, avec des études concertées des partenaires microbiens et végétaux.
L'apprenti(e) sera intégré(e) dans l'équipe bioinformatique du LIPME, composée de 4 ingénieurs permanents et d'un CDD. L'équipe a des compétences en développement informatique et en analyses de données omiques. Nous disposons également d'une infrastructure informatique avec un cluster Hadoop/Spark de 20 serveurs.
L'apprenti(e) travaillera sur les données issus de deux projets d'étude du soja visant à améliorer les connaissances en particulier sur la résistance de l'espèce au champignon Sclerotinia sclerotiorum et pour faciliter la création de variétés de soja adaptées au sol français. Dans ce contexte, la mission de notre plateforme est de mettre en place l'architecture informatique pour exploiter la diversité génétique du soja. Ainsi, afin d'analyser de manière plus approfondie et rapide l'ensemble des données disponibles, nous avons commencé à mettre en place un « data lake » dédié au soja. Ce « data lake » vise à structurer et normaliser les données et les métadonnées, facilitant ainsi l'intégration automatique et l'interrogation des données massives.
Les objectifs pour l'apprenti(e) seront de :
- Développer de nouvelles requêtes en utilisant Scala et Hadoop pour interroger le data lake
- Développer un pipeline pour ingérer et normaliser les données et les métadonnées provenant d'une ou plusieurs sources de données
- Formaliser une étude des solutions de catalogues pour les systèmes big data
- Participer à la mise en place d'un "Proof Of Concept" à partir de la solution retenue
Formations et compétences recherchées
- Formation : BUT Informatique
- Connaissances en développement informatique : python, java...
- Connaissances en base de données : SQL
- Une appétence pour la biologie
- Curiosité intellectuelle
- Anglais technique
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.
Modalités pour postuler
J'envoie mon CV et ma lettre de motivation
Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises à son règlement intérieur notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.