Technicien-ne en virologie végétale

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Présentation d'INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche qui réunit 12 000 collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l’ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.

Face à l’augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s’engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l’évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales

Important : Ces postes sont ouverts exclusivement aux fonctionnaires et aux agents en CDI relevant des trois fonctions publiques.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l'unité mixte de recherche Plant Health Institute of Montpellier (PHIM) dédiée à la santé durable des plantes et composée de140 agents permanents et 90 non permanents. Les équipes étudient les interactions entre les plantes et leur environnement afin de mieux comprendre les facteurs qui influencent leur état sanitaire, leur croissance et leur productivité.
Vous intégrerez l'équipe Caractérisation et modélisation des épidémies (CAMEPI), comprenant 8 agents permanents et spécialisée dans l'étude des épidémies de maladies des plantes. Vous contribuerez à des travaux visant à améliorer les stratégies de surveillance et de gestion de ces maladies. Vous viendrez en appui d'une ingénieure de recherche et collaborerez avec les autres membres de l'équipe travaillant sur cette thématique.
Vous participerez à des recherches consacrées à la sharka, une maladie virale affectant les arbres fruitiers à noyau. Les travaux menés visent à mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la propagation de cette maladie afin de concevoir et d'optimiser des mesures de gestion adaptées.
Ce poste vous permettra de contribuer à des recherches associant expérimentation, analyses de laboratoire et suivi de matériel biologique. Vous participerez à la production de connaissances sur les interactions entre virus, plantes et vecteurs de transmission, ainsi qu'à l'étude de la diversité génétique des populations virales présentes dans les milieux cultivés et naturels.
Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :
Production de matériel biologique et expérimentations
- Assurer la production et l'entretien du matériel biologique nécessaire aux études (plantes, élevage de pucerons, arrosage et fertilisation).
- Réaliser les inoculations virales et les expérimentations associées, notamment par transmission via pucerons ou par greffage.
- Participer au suivi des expérimentations conduites en conditions contrôlées.
- Contribuer aux collectes d'échantillons en serre et sur le terrain.
Analyses en laboratoire et gestion des échantillons
- Réaliser le diagnostic, la quantification et le génotypage des virus à l'aide de techniques immunologiques et moléculaires.
- Mettre en œuvre des protocoles d'extraction d'ADN et d'ARN, de PCR, de PCR quantitative, de clonage et de préparation d'échantillons pour le séquençage.
- Assurer la gestion de la collection d'isolats viraux et la conservation des échantillons.
- Participer à l'optimisation ou au développement de nouvelles méthodes d'analyse après appropriation des protocoles de routine.
Organisation, suivi et appui collectif
- Tenir un cahier de laboratoire et assurer la traçabilité des activités réalisées.
- Participer à l'analyse et à la présentation des résultats lors des réunions de travail.
- Gérer les stocks, les commandes et le suivi du matériel nécessaire aux expérimentations.
- Contribuer à l'entretien des équipements et au bon fonctionnement des laboratoires communs.
- Participer à l'encadrement technique de stagiaires et de personnels contractuels accueillis dans l'équipe.

Vous réaliserez une partie de vos activités dans des chambres de culture confinées dédiées à l'étude d'organismes réglementés. Le respect strict des procédures de biosécurité, des protocoles expérimentaux et des mesures de prévention en vigueur constituera une exigence essentielle du poste.

Formations et compétences recherchées

Vous avez une formation en biologie moléculaire, virologie, biologie végétale ou dans un domaine proche.
Une première expérience en virologie végétale ou dans un laboratoire de biologie moléculaire serait appréciée, mais n'est pas indispensable.
Savoir-faire :
- Mettre en œuvre des techniques de biologie moléculaire : extraction d'acides nucléiques, PCR, PCR quantitative et clonage.
- Réaliser des analyses virologiques et assurer la gestion d'échantillons biologiques.
- Conduire des expérimentations sur plantes et participer à l'entretien de matériel biologique.
- Utiliser des techniques de séquençage et préparer des échantillons pour analyses génétiques.
- Assurer la traçabilité des activités et exploiter les outils informatiques courants pour le suivi des données.
- Appliquer rigoureusement les procédures de sécurité et de biosécurité.
Savoir-être :
- Intérêt pour les expérimentations biologiques et le travail en laboratoire.
- Organisation, rigueur scientifique et sens du détail.
- Capacité à travailler en équipe et à partager les informations utiles au collectif.
- Autonomie dans la réalisation des missions confiées.
- Sens des responsabilités et respect des procédures.
- Curiosité et capacité à s'approprier de nouvelles méthodes expérimentales.