Ingénieur-e en intégration de données sémantiques et gestion de connaissances

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Présentation d'INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche qui réunit 12 000 collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l’ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.

Face à l’augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s’engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l’évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité à l’Unité Mixte de Recherche (UMR) MISTEA, spécialisée dans le développement de méthodes mathématiques, statistiques et informatiques appliquées aux systèmes agronomiques et environnementaux. L’axe informatique auquel vous serez rattaché est reconnu pour son expertise en ingénierie des connaissances et en technologies du web sémantique, avec des applications en interopérabilité des données et en structuration des connaissances. La collaboration avec la cellule OpenSILEX permettra de renforcer les liens entre les outils de gestion de données expérimentales et les graphes de connaissances, en favorisant une meilleure exploitation des données et la production de ressources sémantiques pour la communauté scientifique. Vous interagirez avec des équipes de recherche nationales et internationales et contribuerez à des projets stratégiques visant à améliorer la gestion et la valorisation des données en agriculture et en environnement.
Vous intégrerez l’axe informatique de l’UMR MISTEA et contribuerez au développement de méthodes et outils d’intégration, de structuration et d’exploitation des données sous forme de graphes de connaissances basés sur des ontologies. Vous jouerez un rôle central dans la consolidation des travaux de recherche sur l’ingénierie des connaissances et l’interopérabilité sémantique, en appui aux projets portés par l’unité.
Vos missions incluront la mise en place de solutions pour l’alignement et l’intégration de données, le développement de pipelines d’annotation sémantique, la gestion et la pérennisation des graphes de connaissances produits au sein de l’unité. Vous faciliterez également l’accès et l’exploitation des graphes pour les scientifiques, en interfaçant les données issues des plateformes OpenSILEX et AgroPortal afin de créer un cycle vertueux d’échange et de valorisation entre les travaux de MISTEA sur les systèmes d'information et les ressources sémantiques.
En parallèle, vous contribuerez à la formation et à l’animation scientifique autour des technologies du web sémantique et des principes FAIR au sein de MISTEA et de ses réseaux (SESAME, IN-OVIVE, CATIs).
Vous travaillerez en lien étroit avec les chercheurs et ingénieurs impliqués dans l’exploitation des graphes de connaissances. Vos activités comprendront le développement et la maintenance de graphes de connaissances et d’outils d’intégration de données, la mise en place de méthodes d’enrichissement sémantique et d’alignement d’ontologies/données, ainsi que la conception et l’expérimentation de nouveaux modèles pour la représentation et l’analyse des graphes de connaissances. Vous serez responsable de la gestion technique des flux de données entre OpenSILEX et AgroPortal afin d’assurer une interopérabilité accrue et une meilleure valorisation des données apportées par les cas d'usage d'OpenSILEX.
Vous participerez également aux activités de recherche appliquée sur l’ingénierie des connaissances, notamment sur les méthodes d’extraction d’informations et de raisonnement sur les graphes.
En complément, vous contribuerez à l’encadrement des non-permanents (doctorants, postdoctorants, stagiaires) et à l’animation scientifique dans l’unité.
Le travail s’effectuera en collaboration avec des partenaires académiques et institutionnels nationaux et internationaux.

Le poste ouvre droit à une prime informatique dont le niveau sera déterminé en fin de campagne, sous réserve que le/la candidat-e retenu-e réponde aux conditions d'attribution de ladite prime.

Votre activité pourra inclure des déplacements ponctuels pour des réunions de projets et des formations.

Formations et compétences recherchées

Vous êtes titulaire d’un diplôme d’ingénieur ou d’un doctorat en informatique, avec une spécialisation en ingénierie des connaissances, science des données ou web sémantique.
Vous justifiez d’une expérience avérée en modélisation sémantique, intégration de données et gestion de graphes de connaissances, avec une maîtrise des technologies associées (ontologies, RDF, SPARQL, OWL, graphes de connaissances).
Des compétences en programmation (Python, Java, etc.) et en développement de workflows d’analyse de données sont attendues, ainsi qu’une bonne connaissance des principes FAIR et des infrastructures de stockage et de calcul.
La capacité à manipuler des données volumineuses et hétérogènes, ainsi que des compétences en extraction d’information et apprentissage automatique, seraient un plus.
En complément des compétences techniques, vous êtes autonome, organisé-e, et capable de travailler en équipe dans un environnement de recherche interdisciplinaire.
Une bonne aptitude à la rédaction scientifique, à la formation et à l’animation de réseaux sera également valorisée.
Une expérience antérieure dans les domaines de l’agriculture, de l’environnement ou de la science ouverte serait un atout.