Ingénieur-e en science des données biologiques

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Présentation d'INRAE

INRAE, Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, est un organisme public de recherche qui réunit 12 000 collaborateurs au sein de 272 unités réparties sur 18 centres en France. Premier organisme mondial spécialisé sur l’ensemble agriculture – alimentation – environnement, INRAE joue un rôle clé pour accompagner les transitions nécessaires face aux grands défis planétaires.

Face à l’augmentation de la population, aux enjeux de sécurité alimentaire, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE s’engage à développer des solutions scientifiques et à accompagner l’évolution des pratiques agricoles, alimentaires et environnementales.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l'infrastructure d'Infectiologie Expérimentale des Rongeurs et Poissons (IERP), qui regroupe une vingtaine d'agents répartis en trois équipes et spécialisée dans l'étude des maladies infectieuses animales. Cette infrastructure, ouverte à la communauté scientifique académique et industrielle, offre un environnement idéal pour la conduite de projets en milieu confiné, des organismes modèles aux animaux de rente. Vous serez accueilli-e au sein de l'équipe d'exploration fonctionnelle pour développer des outils numériques d'aide à la décision en aquaculture, pour des applications en médecine vétérinaire de précision.
L'évolution des dispositifs expérimentaux et l'arrivée de nouvelles technologies génèrent des volumes et types de données dont la gestion et l'analyse requièrent une expertise dédiée. Vous interviendrez dans un contexte d'augmentation et de diversification des données multimodales issues des projets de l'infrastructure (paramètres environnementaux, imagerie, cytométrie, zootechnique, génétique, comportement, microbiote, virologie…) nécessitant la mise en place d'outils analytiques avancés.
Ce poste présente des enjeux majeurs pour accompagner la transition numérique de l'infrastructure, renforcer la gestion et le traitement de données complexes et contribuer à l'amélioration des connaissances en santé animale. Au sein d'un environnement collaboratif et dynamique (INRAE, ENS, AgroParisTech, Institut Pasteur, Institut Curie), vous participerez au développement d'outils d'analyse prédictive et d'aide à la décision répondant aux besoins des équipes de recherche et des acteurs de la filière. Une partie de votre activité sera mutualisée en vue de construire un pôle autour de l'analyse de données complexes, à destination d'autres unités du département Santé Animale d'INRAE ayant les mêmes besoins de compétences.
Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :
Gestion et structuration des données
- Concevoir et mettre en place la structure des bases de données et des systèmes d'information multimodaux ;
- Assurer le recueil, la structure, la sauvegarde, le stockage et la gestion des données ;
- Élaborer le plan de gestion des données de l'unité en lien avec les services informatiques et l'infrastructure EMERG'IN ;
- Évaluer la qualité des codes, des résultats et des interprétations.
Modélisation, analyse et outils décisionnels
- Concevoir des modèles mathématiques et des méthodes de modélisation, calcul et visualisation ;
- Développer des outils d'analyse des données biologiques multimodales ;
- Implanter, adapter et mettre au point des logiciels pour l'analyse prédictive et l'aide à la décision en médecine vétérinaire ;
- Concevoir des systèmes d'information à visée décisionnelle.
Appui scientifique, formation et réseaux
- Accompagner les utilisateurs : conseil, participation à l'analyse, interprétation et validation des résultats ;
- Contribuer au montage de projets scientifiques avec les partenaires académiques et professionnels ;
- Former aux principes et à l'utilisation de méthodes d'analyse des données multimodales ;
- Participer au choix, aux demandes de financement et à l'acquisition de nouveaux équipements de phénotypage et d'analyse ;
- Représenter l'infrastructure dans les instances, animer des réseaux professionnels et organiser des évènements scientifiques.

Formations et compétences recherchées

Une formation de niveau diplôme d'ingénieur ou doctorat est attendue dans les domaines de la biostatistique, biomathématique, bio-informatique, modélisation ou sciences des données appliquées à la biologie.
Une première expérience dans l'analyse de données complexes ou multimodales en lien avec les sciences du vivant serait appréciée.
Savoir-faire :
- Concevoir des modèles mathématiques et des plans d'échantillonnage ;
- Utiliser des méthodes statistiques, de simulation numérique et d'algorithmique ;
- Développer des outils d'analyse, de calcul et de visualisation ;
- Assurer le suivi qualité des analyses et des résultats ;
- Maîtriser un ou plusieurs langages de programmation et outils informatiques ;
- Concevoir des outils pédagogiques et accompagner les utilisateurs ;
- Communiquer en anglais ;
- Savoir rendre compte.
Savoir-être :
- Rigueur et sens de l'organisation ;
- Capacité d'adaptation et de décision ;
- Aptitude au travail en équipe multidisciplinaire ;
- Qualités relationnelles ;
- Autonomie ;
- Sens des responsabilités et des valeurs de l'établissement.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez :

- de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

1. Je télécharge le guide Guide des candidats pdf - 2.31 Mo
2. Je note le numéro du profil IR26-SA-1
3. Je postule Espace d'inscription