Ingénieur-e d’études en écologie aquatique - suivi sanitaire de l'anguille en France

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein de l'unité expérimentale d'écologie et d'écotoxicologie aquatique (U3E). Dans l'infrastructure de recherche INRAE dédiée à l'étude du vivant dans les milieux aquatiques continentaux (IR LIFE), l’U3E a en charge la gestion de plusieurs dispositifs d'observation, d'expérimentation et de collections, dont l'observatoire de recherche en environnement sur les poissons diadromes dans les fleuves côtiers (ORE Dia PFC).

Vous serez intégré-e à l’équipe du pôle de recherche et de développement OFB, INRAE, Institut Agro et UPPA sur les poissons migrateurs dans leurs environnements (Pôle R&D MIAME) à laquelle l’U3E est partie prenante. Ce pôle vise à améliorer les connaissances sur les poissons migrateurs amphihalins et leurs habitats continentaux et marins. La thématique générale est la démographie et l’évolution des populations, l’étude de leurs réponses aux impacts anthropiques, la qualité et la connectivité de leurs habitats et les moyens de les préserver ou de les restaurer. Le pôle couvre l’ensemble du territoire français, y compris les territoires ultra-marins dans la limite des forces disponibles. 

Le projet :

L’état de santé des anguilles de l’Hexagone n’est connu qu’à travers quelques études locales, souvent dans le cadre de projets de recherche ponctuels. Au-delà d’un manque de connaissance scientifique de l’espèce sur notre territoire, cette lacune peut poser des problèmes de gestion, notamment dans le cadre des projets de translocation (repeuplement) effectués dans une optique de restauration de l’espèce.

Ce projet permettra d’avoir un panorama national (Hexagone) de l’état de santé de l’anguille européenne dans les bassins abritant une pêcherie professionnelle. Pour cela, des analyses sanitaires seront effectuées sur des civelles et des anguilles jaunes et argentées collectées auprès de pêcheurs professionnels. Des mesures biométriques seront effectuées et sept organismes pathogènes seront recherchés chez les individus collectés.

En parallèle, le projet prévoit également la réalisation d’une synthèse bibliographique sur les études relatives à l’état de santé des anguilles en France sur les quarante dernières années. Dans un cadre de gestion, cette synthèse a pour objectif de regrouper en un seul document les connaissances relatives aux agents pathogènes, à leurs effets sur les anguilles ainsi qu’à leur répartition sur le territoire (Hexagone).

Ce projet sera réalisé avec des partenaires extérieurs à l’U3E, notamment le comité national des pêches maritimes et des élevages marins (CNPMEM).

Votre mission consistera à contribuer à la coordination opérationnelle du projet, à superviser la collecte des données sanitaires sur les anguilles, à bancariser les données produites, ainsi qu’à produire des livrables, notamment le rapport final d’exécution du projet et la synthèse bibliographique sur l’historique des études relatives à l’état de santé des anguilles en France.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1. Assurer la coordination opérationnelle du projet en assurant le lien avec les partenaires et prestataires du projet (notamment CNPMEM) et rédiger le rapport final d’exécution.
2. Rédiger une synthèse bibliographique des études menées sur l’état sanitaire de l’anguille européenne en France métropolitaine sur les quarante dernières années (littérature grise et scientifique).
3. Superviser la collecte des données sanitaires sur les anguilles jaunes et argentées en complétant les suivis existants réalisés dans le cadre du Data Collection Framework (DCF) avec le protocole de suivi sanitaire et assurer la transmission des échantillons aux laboratoires d’analyses sanitaires.
4. Effectuer la bancarisation des données produites par l’U3E et le CNPMEM.

Conditions particulières d’activité : Travail de bureau

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Niveau Bac+3 en écologie aquatique, biologie des populations, écopathologie, ou gestion des ressources halieutiques.

Connaissances et compétences souhaitées :

• Connaissances générales sur l’écologie aquatique ;
• Compétences en coordination de projet ;
• Compétences en gestion de base de données seraient un plus.

Expérience appréciée :

• Une expérience dans le contexte de l’écologie aquatique serait un plus.

Aptitudes recherchées :

• Faire preuve de rigueur et d’organisation ;
• Faire preuve de facultés d’analyse et de synthèse ;
• Adapter votre communication aux divers interlocuteurs : scientifiques, comité des pêches, bureaux d’études… ;
• Bonnes aptitudes rédactionnelles ;
• Travailler en équipe ;
• Autonomie.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- de la prise en charge à 50 % de votre cotisation à la complémentaire santé collective ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Merci de transmettre une lettre de motivation et un CV par e-mail à :

• clarisse.boulenger@inrae.fr
•  Guirec.Andre@ofb.gouv.fr

Date limite pour postuler : 05/12/2026

Entretiens prévus semaine 50 (8 au 11/12/2026)