Post-doctorat en génétique des caractères phénotypiques qui peuvent contribuer à l’amélioration de la qualité du tourteau de tournesol

Retour à la liste des résultats

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous travaillerez au sein de l'équipe "ASTR" (Tolérance aux stress abiotiques du tournesol), rattachée à l'unité mixte "LIPME" (Laboratoire des interactions plantes - microbes - environnement), une équipe dynamique, avec une expertise reconnue au niveau mondial dans la génétique et dans la génomique du tournesol, et qui dispose d'un accès direct aux ressources génomiques et biologiques et aux outils de phénotypage à haut débit existants pour cette espèce. Réduire la dépendance aux importations de protéines végétales est un objectif stratégique pour la France. Le tourteau de tournesol est riche en acides aminés soufrés et dépourvu de facteurs antinutritionnels, mais il présente des limitations telles qu'une faible teneur en protéine et lysine et des problèmes de décorticage des graines. L'objectif de ce post-doctorat est de caractériser les bases moléculaires des caractères qui pourraient améliorer la qualité de ce tourteau. Vous réaliserez d'abord des analyses de génétique d’association (GWAS) en utilisant comme phénotypes la teneur en protéine, la composition en acides aminés et l’aptitude au décorticage des graines. Ensuite, vous analyserez les lignées présentant des phénotypes extrêmes par transcriptomique (RNAseq) pour obtenir des données complémentaires. Les analyses de GWAS et de RNAseq seront effectuées à partir de graines cultivées sur deux années différentes afin d’étudier l’interaction des caractères avec l’environnement. A noter que les graines de la première année de cultivation ont déjà été produites, et une partie importante du phénotypage a déjà été effectuée, à savoir la teneur en protéine et la composition en acides aminés, ce qui permettra de commencer rapidement les analyses. Vos tâches incluront, entre autres, des analyses des données de génétique d'association (GWAS) et de transcriptomique (RNAseq), ainsi qu'une analyse exhaustive de la littérature scientifique existante sur le déterminisme génétique des caractères en étude. Vous voyagerez afin de présenter les résultats de vos recherches dans le cadre de congrès ou de réunions avec les dispositifs de soutien à la recherche semencière et les instituts techniques impliqués dans la valorisation des oléagineux. 

Formations et compétences recherchées

Nous cherchons un(e) candidat(e) combinant une expertise en génétique, une maîtrise des analyses de données génomiques (par ex. GWAS), et de bonnes bases de statistique appliquée à la biologie. Une connaissance d’un langage de programmation adapté au contexte de la biostatistique (de préférence "R") est souhaitée, et des compétences de base en laboratoire de biologie moléculaire seront aussi appréciées.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- de la prise en charge à 50 % de votre cotisation à la complémentaire santé collective ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation