OFFRE DE THESE 2027 : Impact d’une alimentation contenant du Bacillus thuringiensis (Bt) sur la physiologie de l’abeille à miel

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Présentation de l’Unité de Recherche Abeilles et Environnement :

L’unité est composée de 24 permanents avec pour objectifs de favoriser la protection des abeilles dans un contexte de transition agro-écologique. Afin de faire progresser les connaissances et promouvoir la recherche de solutions innovantes pour la protection des abeilles mellifères et la conservation des abeilles sauvages l’unité dispose de compétences pluridisciplinaires en écologie, toxicologie, physiologie et biologie du comportement, à des échelles d’étude allant du gène au paysage.

https://abeilles-et-environnement.paca.hub.inrae.fr/

Présentation de l'équipe PHYBAC:

L’équipe "Physiopathologies liées aux bactéries sporulantes du groupe Bacillus cereus" (EMR CNRS PHYBAC, Institut Sophia Agriobiotech) s'intéresse aux mécanismes de défense d'un organisme contre les agresseurs environnementaux et aux conséquences physiopathologiques lorsque ces mécanismes échouent. Les Bacillus sont des bactéries sporulantes offrant un large éventail d'utilisations en agriculture de par leurs propriétés de stimulation de la croissance des végétaux, d'activation de leurs défenses naturelles, ou encore de protection contre différents bioagresseurs via la production d'antibiotiques, d'antifongiques et de substances entomopathogènes. En se concentrant sur les interactions Drosophila-spores, l’équipe étudie la physiologie de l'intestin et le maintien de son homéostasie cellulaire et la réponse immunitaire innée contre ces bactéries.

https://institut-sophia-agrobiotech.paca.hub.inrae.fr/

Environnement de travail, missions et activités

Les bio-insecticides à base de spores de *Bacillus thuringiensis* (Bt) sont largement utilisés en agriculture pour cibler des insectes ravageurs spécifiques. Cependant, en raison de leur résistance aux stress environnementaux et de leur persistance, les spores de Bt sont désormais très répandues dans l'environnement et la chaîne alimentaire. Bacillus thuringiensis appartient au groupe Bacillus cereus sensu lato (Bc s.l.), qui comprend des agents pathogènes opportunistes responsables d'intoxications alimentaires et constituant une cause majeure de toxi-infections alimentaires en France et en Europe. Ces agents peuvent perturber l'équilibre du microbiote intestinal (dysbiose). 

Afin d'examiner les conséquences d'une ingestion chronique de spores de Bt d’origine agricole sur la physiologie intestinale, nous utiliserons des ouvrières d’abeilles, comme modèle d'insecte non ciblé. Les abeilles sont naturellement exposées lors de leur activité de butinage en pleins champs. Des analyses en microbiologie, en biologie moléculaire ou encore sur le métabolisme permettront de mieux comprendre les mécanismes sous-jacents qui affectent la physiologie intestinale. Des expériences de terrain et sur le comportement sont également à prévoir.

La formation en physiologie intestinale sera réalisée à Sophia Antipolis (équipe PHYBAC) et les expériences sur les abeilles et la formation en microbiologie (production de spores par exemple) seront réalisées à INRAE à Avignon dans deux unités suivantes : L’unité Abeilles et Environnement est spécialisée sur le modèle abeille et les différentes techniques de laboratoire associées, tandis que l’UMR SQPOV (équipe SporAlim) est spécialisée  dans l’étude de la génétique et la physiologie des bactéries sporulées et en particulier du groupe B. cereus sensu lato.  L’UMR SQPOV est classée en zone à régime restrictif (ZRR), l’accès aux laboratoires est soumis à validation par le SGDSN (Secrétariat général de la défense et de la sécurité nationale).

L’équipe d’accueil transdisciplinaire à Avignon, Abeilles et environnement, compte une vingtaine de membres. Le/la doctorant.e travaillera notamment aux côtés d’un.e post-doctorant.e menant des recherches sur des thématiques connexes au sujet, ainsi qu’en collaboration avec des personnels techniques spécialisés dans les différents domaines d’étude et un technicien apicole.

Le financement de la thèse est acquis dans le cadre d’un projet financé par le programme Ecophyto II+.

Objectifs de la thèse

Evaluer les réponses physiologiques et comportementales de l’ingestion de Bt sur une espèce non-cible, l’abeille à miel. La thèse comporte un travail expérimental en laboratoire, ainsi que des analyses de terrain avec la collecte d‘échantillons biologiques.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée :

Etudiant.e titulaire d’un Master 2 en biologie ou équivalent avec des compétences en analyses de laboratoire.

Profils du candidat(e)

La thèse nécessite des connaissances générales en biologie comportementale, en microbiologie et en biologie moléculaire. Des fortes compétences dans l’analyse des données avec l’utilisation du logiciel R sont attendues pour mener à bien cette étude. Le travail impliquant la manipulation de colonies d’abeilles, une affinité pour la manipulation des insectes et l’absence d’allergie connue au venin est requise.

Autres informations

• Aptitudes de terrain : Appétence et aisance pour la manipulation des ruches et des abeilles. Goût pour le travail de terrain (conditions météo variables) combiné au travail rigoureux en laboratoire.
• Sécurité : Absence d'allergie aux piqûres d'abeilles (impératif de sécurité).
• Compétences techniques : Minutie et rigueur dans les manipulations de précision. Intérêt pour l'analyse de données (statistiques, suivi vidéo).
• Langues : Français (courant) ; Anglais (réunions et lecture de la littérature scientifique).

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- de la prise en charge à 50 % de votre cotisation à la complémentaire santé collective ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Transmettre une lettre de motivation et un CV à Freddie-Jeanne Richard (freddie-jeanne.richard@inrae.fr) & Raphael Rousset (raphael.rousset@univ-cotedazur.fr)

Date limite pour postuler : 14/12/2026 

 

Les candidatures seront évaluées au fil de l’eau, l’offre de thèse pourra donc être pourvue avant la clôture de la période de candidature.