M2 en caractérisation de la diversité génétique de la collection patrimoniale de féverole (Vicia faba L.) conservée au sein du CRB PROTEA

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

 Vous serez accueilli(e) au sein de l’équipe génétique et génomique des Espèces Cibles Protéagineux (ECP) de l’UMR 1347 Agroécologie à Dijon et vos missions s’inscriront dans le cadre de la caractérisation de la diversité de la collection patrimoniale de féverole faisant partie intégrante du centre de ressources biologiques (CRB) PROTEA. L’équipe ECP est une équipe de recherche pluridisciplinaire qui est spécialisée dans l’étude des légumineuses à graines. Elle développe des ressources génétiques et génomiques chez le pois, la féverole, le lupin et la lentille et s’investit dans l’amélioration variétale. Elle mène ses activités de recherche et de pre-breeding en collaboration avec un réseau d’acteurs à l’échelle nationale et internationale.

Vous serez plus particulièrement impliqué(e) dans l’analyse de données, avec pour missions de :

- traiter les données de génotypage pour décrire la diversité moléculaire de la collection. Ces données sont déjà disponibles et ont été recueillies en ayant recours à une puce à SNP ;

- rassembler les données de phénotypage et analyser la diversité phénotypique mesurée lors des mises en culture des accessions de la collection. Tous les ans, 20 à 30 descripteurs phénotypiques sont mesurés sur environ un douzième de la collection, de sorte que toutes les accessions soient régénérées et caractérisées au moins une fois dans un cycle de 12 ans. Il faudra rassembler des données hétérogènes, les vérifier et les standardiser ; 

- identifier les génotypes très proches et vérifier sur la base des phénotypes mesurés la pertinence de leur conservation.

Lors du stage, vous serez aussi amené(e) à participer à une saison de phénotypage en serre pour vous familiariser avec la diversité de la collection et les notations réalisées.

Vous serez accueilli(e) au sein d’une équipe de recherche pluridisciplinaire et vous travaillerez en étroite collaboration avec les gestionnaires scientifiques et opérationnels du CRB et avec des experts en génétique et en bioinformatique. Vous devrez faire preuve d’une forte motivation pour caractériser et apprécier la diversité génétique végétale. 

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Génétique et amélioration des plantes ou équivalent.

Connaissances requises en génétique et vivement souhaitées en biostatistiques et en sélection végétale.

Expérience en R et maitrise de l’anglais scientifique fortement recommandées.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation