Stage : Relier phénotypes de laboratoire et performance au champ chez une micro-guêpe du genre Trichogramma

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Contexte :

Afin d’optimiser le déploiement en champ des insectes utilisés en biocontrôle, il est capital de pouvoir faire le lien entre les traits phénotypiques mesurés en laboratoire et les performances mesurées en champ. Dans ce contexte, nous cherchons à développer des approches de phénotypage à haut débit à l’aide d’outils de vidéo-tracking visant à caractériser différents traits biologiques chez une espèce de trichogramme. Les trichogrammes sont des micro-guêpes parasitoïdes largement utilisées en biocontrôle contre les lépidoptères ravageurs, notamment la pyrale du maïs. 

Objectifs :

Les objectifs de ce stage (1) sont de caractériser, à l’aide de méthodes d’acquisition et d’analyse vidéo disponibles et développées au sein de l’équipe, la diversité phénotypique d’une quarantaine de lignées d’une espèce de micro-guêpe du genre Trichogramma génétiquement différentes, et (2) mettre en relation les traits phénotypiques caractérisés en laboratoire avec des traits liés à leur performance « terrain » (données déjà acquises). Les traits étudiés en laboratoire seront des traits d’histoire de vie (fécondité, longévité, etc.) et un ensemble de traits comportementaux (activité, exploration, dispersion, etc.). 

L’étudiant.e participera notamment aux activités suivantes :

• L’élevage et le suivi des différentes lignées ;
• La préparation et la réalisation des expériences en laboratoire ;
• Le traitement des images et des vidéos ;
• L’analyse statistique des données afin de caractériser la variabilité phénotypique des lignées ; 
• La mise en relation des phénotypes caractérisés en laboratoire avec les données de performance au champ déjà acquises, afin d’identifier les caractéristiques phénotypiques associées à l’efficacité des différentes lignées en tant qu’agents de biocontrôle.

La ou le stagiaire sera formé.e aux différents outils et protocoles utilisés au cours du projet.

 

Profil recherché : nous recherchons un.e candidat.e motivé.e par la biologie des insectes et l’écologie comportementale, faisant preuve de rigueur, de patience et de précision. La ou le stagiaire devra apprécier le travail en équipe. Un intérêt pour l’acquisition et l’analyse d’images ou le traitement vidéo assisté par ordinateur constituera un atout. Des bases en statistiques (R) seront appréciées.

Formation recherchée : étudiant.e dans les domaines de l’écologie, la biologie ou de l’agronomie (niveau Bac+5).

Formations et compétences recherchées

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

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