Stage de M2 : comprendre les potentiels liens entre composition des peuplements forestiers, diversité et abondance des communautés d’hétérocères et leurs prédateurs vertébrés (oiseaux, chiroptères) en forêt d’Orléans.

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Contexte scientifique 

Les chênaies hébergent une diversité d’hétérocères (papillons de nuit) particulièrement importante. Seules quelques-uns (essentiellement 5) présentent des phases de pullulation qui peuvent contribuer au dépérissement des arbres. Il est probable que la composition en essences, l’état de santé des arbres, la diversité et l’abondance des autres phyllophages et des prédateurs vertébrés (oiseaux et chauves-souris) affectent la dynamique de ces ravageurs. Nous faisons l’hypothèse que l’abondance des hétérocères ravageurs est moindre dans les peuplements mélangés que dans les chênaies pures, dans les peuplements sains que dépérissant et dans ceux où les autres hétérocères compétiteurs et les prédateurs sont abondants et riches en espèces. 

Plus précisément, les hétérocères ravageurs des chênaies s’inscrivent au sein d’un réseau trophique plus large où les régulations top-down et bottom-up façonnent les communautés. Principalement, les différents stades des hétérocères sont sujet à la prédation des vertébrés (e.g. oiseaux, chauve-souris, souris) et des invertébrés (e.g. coléoptères) ainsi qu’aux parasitoïdes (e.g. guêpes Ichneumonidae et Brachonidae) et aux virus/pathogènes. Dans la forêt de Bialowieza (Czeszczewik et al., 2020), les pullulations de rongeurs sont positivement corrélées au réchauffement et à la fréquence des glandées, l’abondance de ces rongeurs étant positivement associée à celle des gobemouches à collier (année en cours) et négativement à celle des chenilles de la Chematobie - Operophtera brumata (année suivante). Pour des chenilles d’Orgyia leucostigma en cage, les oiseaux prédateurs causent plus de mortalité sur grosses larves que les prédateurs invertébrés, les petites larves échappant globalement à la prédation par dispersion (Medina and Barbosa, 2002). Les prédateurs invertébrés consomment les pupes d’O. brumata affectant sa dynamique (Heisswolf et al., 2009) tandis que parmi un assemblage d’ennemis naturels du Bombyx disparate – Lymantria dispar (comprenant des coléoptères et les des guêpes parasitoïdes), les prédateurs naturels généralistes semblent les plus importants (López-Pantoja et al., 2024). Finalement, les chauves-souris consomment moins les hétérocères sensibles à leur fréquence d’écholocalisation, c’est l’hypothèse allotonique (Pavey et al., 2006; Schoeman and Jacobs, 2011). Cette rapide vue de la littérature souligne la complexité des cascades trophiques en jeu dans les régulations des hétérocères et la nécessité d’études plus approfondies sur ces communautés d’insectes nocturnes en lien avec leur environnement.

Depuis un an (2026) et pour encore un an (2027), nous testons notre hypothèse sur le dispositif expérimental OPTMix, en forêt d’Orléans (dispositif étudiant l’influence de la gestion forestière sur différents paramètres de production et de biodiversité) en disposant des pièges lumineux et des pièges acoustiques passifs (AudioMoths) dans des parcelles de chênes et de pins, purs ou en mélange et utilisant l’IA pour identifier les espèces de papillons, d’oiseaux et de chauve-souris. Ce projet s’inscrit dans le cadre du projet SAIN (Suivi des Insectes Nocturnes) financé par l’OFB et dans une thèse étudiant les déterminant biotiques, abiotiques et paysagers des défoliations des chênaies françaises (2025-2028). 

Objectifs et missions du stage

Le stage de master 2 se concentre sur l’étude des prédateurs vertébrés (oiseaux et chiroptères) via l’analyse des enregistrements sonores réalisés entre mars et novembre 2026. Plus particulièrement les questions de recherche centrales du stage seraient : (1) la composition en essences des peuplements influence-t-elle les communautés d’oiseaux et de chauve-souris ? (2) quel est le lien entre richesse spécifique, abondance et composition des communautés d’hétérocères et de prédateurs vertébrés ?

Les principales missions du stage seront : 

• Organiser le terrain :  préparation du matériel, mise en place et récupération des pièges lumineux et enregistreurs sonores en forêt d’Orléans (une fois par mois). 
• Analyser les fichiers sonores via le logiciel EcoSignal qui implémente les modèles d’IA Birdnet et Batdetect2 dans le but de détecter et identifier les espèces d’oiseaux et de chauve-souris. 
• Analyser les liens entre richesse spécifique, abondance et composition des communautés d’hétérocères et de prédateurs vertébrés. 

Formations et compétences recherchées

Aux vues du sujet et des missions, certaines connaissances et compétences sont requises ou souhaitées : 

• Master en écologie ou analyse de données 
• Appétence pour l’analyses statistique en écologie (particulièrement en écologie des communautés)
• Potentiellement des bases en machine learning
• Des connaissances naturalistes sur les oiseaux et/ou les chauve-souris seraient un plus (capacité à reconnaître les chants et cris, en particulier des chauves-souris)

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

- logement sur place possible

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation