Stagiaire en analyse de données de géolocalisation pour détecter précocement des troubles de santé d’ovins

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Nous recherchons un stagiaire en analyse statistique de données appliquée au suivi individuel d’animaux pour nous appuyer dans l’étude de détection précoce des troubles de santé chez les petits ruminants.

Vous rejoindrez l’unité de recherche GenPhySE et collaborerez avec les équipes MAGE et ALIEN, spécialisées en génétique quantitative et en analyse de données, notamment appliquées à l’amélioration des performances et de la santé des petits ruminants.

L’enjeu du stage est d’évaluer si les variations d’activité des animaux peuvent permettre de détecter précocement des troubles de santé, avant l’apparition de signes observables par les éleveurs. Vous contribuerez ainsi à mieux valoriser les données de suivi individuel des animaux et à identifier de nouveaux indicateurs utiles pour le suivi de leur santé.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

Analyse des données d’activité

• Exploiter les positions individuelles enregistrées trois fois par seconde durant six semaines. 
• Calculer différentes métriques décrivant l’activité des animaux. 
• Analyser ces métriques à différentes échelles de temps. 
• Décrire la signature d’activité individuelle de chaque animal sur les six semaines d’observation. 
• Étudier les niveaux d’activité des animaux ne présentant pas de troubles de santé observés. 

Détection des troubles de santé

• Identifier les changements de trajectoire dans les signatures d’activité. 
• Comparer les variations d’activité avec les observations du cahier d’élevage. 
• Analyser l’activité des animaux concernés par des événements sanitaires. 
• Rechercher des signes d’activité associés à l’apparition de troubles de santé. 
• Utiliser le logiciel R pour traiter et analyser les données. 

Vous travaillerez sur une base de données originale comprenant 240 agneaux suivis individuellement pendant six semaines grâce à la technologie de localisation UWB. Ce sujet propose une approche novatrice qui pourrait ouvrir la voie à de nouveaux indicateurs et à des outils de suivi directement utiles aux éleveurs.

Formations et compétences recherchées

Vous êtes en formation de niveau Master 2 ou diplôme d’ingénieur, avec une spécialisation en statistiques, analyse de données ou domaine proche, et un intérêt pour l’analyse de données appliquée aux productions animales.

Une première expérience en analyse de données statistiques ainsi que des notions de Linux seront appréciées. 

Savoir-faire :

• Utiliser le logiciel R 
• Manipuler et traiter des jeux de données de grande taille. 
• Mettre en œuvre des méthodes statistiques. 
• Réaliser des analyses de données longitudinales. 
• Interpréter et présenter des résultats statistiques. 

Savoir-être :

• Goût pour l’analyse et la recherche. 
• Rigueur dans le traitement des données. 
• Capacité à travailler en équipe. 

Votre qualité de vie à INRAE

Un environnement de travail multi-culturel

Un cadre de travail convivial

Un engagement en faveur de la diversité et de l’inclusion

Envie de rejoindre une équipe dynamique dans un cadre de travail stimulant 

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation