Stage : Intitulé : Modélisation de l’impact hydraulique des obstacles à la migration sur l’environnement physique des poissons en mouvement

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de l’unité de recherche EABX, dans l’équipe FREEMA pour un travail portant sur les effets des obstacles anthropiques sur les conditions de migration des poissons, en lien avec le projet DEBBARRAGE, financé par la région Nouvelle-Aquitaine. Le stage contribuera à formaliser une représentation hydraulique des obstacles à la migration, afin de produire des scénarios utilisables dans des modèles bioénergétiques individuels. 

Contexte

Les obstacles présents dans les cours d’eau ne font pas qu’altérer leur continuité (Baudoin et al., 2014; Van Puijenbroek et al., 2019), ils perturbent également les conditions hydrauliques tel que température, vitesse d’écoulement, hauteurs d’eau, zones de turbulence, et ce de façon différente selon les débits et la saison.

Pour comprendre les conséquences des obstacles sur la migration, il est donc nécessaire de dépasser la lecture binaire franchissable/non franchissable afin de considérer comment les modifications de l’environnement hydrodynamique se répercutent sur les poissons. Un même obstacle peut imposer un effort locomoteur bref mais intense, provoquer un retard migratoire, augmenter la dépense énergétique cumulée, altérer les possibilités de récupération, ou accroître la mortalité directe ou différée (Croze, 2008.; Haro et al., 1998). Mais pour pouvoir étudier ces effets diffus des obstacles sur les poissons, il est nécessaire en un premier temps de caractériser de façon systématique et formalisée les modifications des facteurs hydrauliques qui en découlent. Une attention particulière sera portée sur la traduction de ces effets en grandeurs utilisables dans une approche énergétique de la migration des poissons (actuellement en développement dans notre groupe de recherche).

Encadrement et collaboration

Le stage sera co-encadré par Paul Benne (doctorant Univ. Bordeaux), et Mehdi CHERIF (Chargé de recherche, INRAE), dans le cadre de travaux menés sur les effets des obstacles à la migration piscicole et leur interprétation énergétique. Le ou la stagiaire collaborera également avec Charlotte Récapet, maîtresse de conférence à l’université de Pau et des Pays de l’Adour. D’autres collaborations seront envisagées avec des membres de l’équipe de recherche FREEMA, ainsi qu’une participation active à la vie quotidienne de l’équipe de recherche.

Objectifs du stage 

L’objectif principal de stage sera d’identifier les variables environnementales modifiées par différents types d’obstacles à la migration piscicole, puis de traduire ces modifications en scénarios quantitatifs ou semi quantitatifs mobilisables pour un modèle bioénergétique individuel. Il se déclinera selon les tâches suivantes : 

• Réaliser une synthèse bibliographique afin Identifier :

1.  les variables hydrauliques modifiées par les obstacles qui impactent la migration des poissons (vitesse, hauteur d’eau, débit, turbulence, attractivité, etc.),
2.  les caractéristiques d’un obstacle qui permettent de prédire son effet sur ces variables hydrauliques d’intérêt pour la migration piscicole.

• Analyser de façon exploratoire les relations entre ces caractéristiques et les paramètres hydrauliques sélectionnés, ainsi que leur variation, selon les débits et les conditions saisonnières.
• Proposer des formulations mathématiques génériques reliant caractéristiques de l’obstacle et paramètres hydrauliques.

Activités principales

• Rechercher, sélectionner et organiser les informations recueillies dans la littérature scientifique pertinente.
• Interpréter et éventuellement manipuler les données disponibles en accès libre, reliant obstacles et paramètres hydrauliques.
• Conceptualiser, formaliser et modéliser l’impact des obstacles anthropiques sur les paramètres hydrauliques locaux des cours d’eau.
• Comparer et classifier les obstacles selon leurs impacts hydrauliques.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée :  Master 2  en cours en hydraulique, hydrologie, hydromorphologie, modélisation environnementale, sciences de l’eau, ingénierie écologique ou parcours équivalent. 

Connaissances souhaitées : hydraulique, hydrologie, écologie des milieux aquatiques, continuité écologique, migration piscicole, fonctionnement des cours d’eau.

Compétences appréciées : lecture critique d’articles scientifiques, capacité de synthèse, organisation d’une base bibliographique, construction d’une démarche structurée, traitement de données, maîtrise de R.

Aptitudes recherchées : autonomie, rigueur, esprit critique, goût pour les approches pluridisciplinaires mêlant hydraulique, hydrologie, écologie et modélisation. Une sensibilité aux milieux aquatiques, à la migration piscicole ou à l’écologie des poissons sera appréciée.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  2.5 jours de congés par mois de présence effective
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective ;

-d'une prise en charge partielle abonnement domicile/travail (TER, TBM).

Modalités pour postuler

Merci d'adresser votre CV, lettre de motivation et si possible lettres de recommandations (optionnelles), aux contacts mentionnés.