Stage M2 - Agroécologie : Influence du contexte paysager et des pratiques agricoles sur les communautés d’auxiliaires multi-trophiques en vergers

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Contexte du stage :

La réduction de la dépendance aux pesticides par la mobilisation des services rendus par la biodiversité constitue un enjeu majeur de la transition agroécologique (Bommarco et al., 2018). Un levier important consiste à favoriser la régulation naturelle des bioagresseurs par la conservation de leurs ennemis naturels (Begg et al., 2017). Bien que les bénéfices du maintien d’une plus grande diversité taxonomique pour la fourniture de fonctions et services écosystémiques soit bien documentés (Cardinale et al., 2012; Dainese et al., 2019), les effets d’une plus grande diversité d’auxiliaires sur la régulation naturelle demeurent très variables (Jonsson et al., 2017) car ils dépendent notamment d’interactions trophiques complexes encore mal comprises (Barnes et al., 2026; Martin et al., 2013). 

Le contexte paysager et les pratiques agricoles influencent fortement les communautés d’auxiliaires ; les paysages plus hétérogènes et les pratiques agroécologiques tendent à  favoriser l’abondance et la diversité des ennemis naturels (Martin et al., 2019; Petit et al., 2020). Les cultures pérennes, telles que les vergers, offrent des conditions particulièrement stables (e.g. disponibilité en ressources, faibles niveaux de perturbation du sol)  qui pourraient donc promouvoir l'établissement de communautés diversifiées, notamment sur le plan trophique, et stables sur le long terme (Rusch et al., 2017). Cependant, à ce jour, peu d’études ont tenté de caractériser la diversité des réponses des communautés multi-trophiques aux pratiques agricoles locales et à la structure du paysage, ainsi que leurs conséquences potentielles sur la régulation naturelle dans les agroécosystèmes pérennes (e.g. Carbonne et al., 2023; Jiménez-Albarral et al., 2026).

Vous serez accueilli.e au sein de l’équipe « Biodiversité et services écosystémiques » de l’UMR SAVE (Santé et Agroécologie du Vignoble) du centre INRAE Bordeaux Nouvelle-Aquitaine (71 avenue Edouard Bourlaux, 33140 Villenave-d’Ornon), encadré.e par Noé Tarcy (INRAE), Adrien Rusch (INRAE) et Brice Giffard (INRAE-Bordeaux Sciences Agro). Stage conventionné, gratification selon la réglementation en vigueur (env. 660€/mois) et 2.5 jours de congés/mois.

S’inscrivant dans le projet scientifique régional PSGAR-MAIA (MAssification et Intensification des pratiques Agroécologiques en Nouvelle Aquitaine), vous serez en charge d’évaluer les effets du contexte paysager et des pratiques agricoles locales sur les communautés multi-trophiques en vergers de pommiers. Le stage s’articulera principalement autour d’un premier axe (1), tandis qu’un second axe (2) pourra être développé en fonction de l’intérêt porté par le/la stagiaire et du temps disponible.

1. Caractériser, à différentes échelles spatiales, la diversité des réponses des communautés d’auxiliaires au contexte environnemental. Nous étudierons l’effet combiné de l’hétérogénéité paysagère (composition et configuration : e.g. proportion d’habitats semi-naturels, proportion de vergers Bio) et des pratiques agricoles (e.g. pesticides) sur les communautés de chauves-souris, d’oiseaux, d’araignées et de carabes, avec des approches taxonomiques (e.g. richesse, abondance) et basées sur les traits fonctionnels (e.g. mode de chasse, mobilité, régime).
2. En complément, une analyse exploratoire pourra être menée afin d’évaluer les associations entre différents niveaux trophiques (e.g. prédateurs vertébrés, arthropodes prédateurs, insectes phytophages) et d’examiner dans quelle mesure ces relations sont modulées par les principaux facteurs environnementaux identifiés dans le volet 1.

Le/la stagiaire aura pour mission d’analyser les données, déjà collectées au sein d’un site expérimental situé dans le Limousin, caractérisant les communautés d’auxiliaires vertébrés (points d’écoute oiseaux, acoustique passive chauves-souris) et d’invertébrés échantillonnés au sol et dans la canopée (pièges Barber, battage). Des données complémentaires seront également disponibles sur l’abondance d’autres groupes taxonomiques d’arthropodes prédateurs et phytophages identifiés à la famille ou à l’ordre (e.g. pucerons, punaises, fourmis, opilions, cicadelles).

Le stage débutera par une synthèse bibliographique portant sur les effets de l’hétérogénéité paysagère et des pratiques agricoles locales sur l’abondance et la diversité des principaux groupes taxonomiques étudiés, en particulier dans les systèmes pérennes, ainsi que sur les grands principes d’écologie du paysage et des communautés pertinents pour l’étude. Dans un second temps, le/la stagiaire prendra en main les données et nous définirons ensemble les questions de recherche et les hypothèses à tester. Enfin, le/la stagiaire conduira les analyses statistiques pour répondre aux questions découlant de l’axe 1 et, le cas échéant, de l’axe 2. 

Références bibliographiques :

Barnes, A.D., Brose, U., Eisenhauer, N., Berti, E., Brauns, M., Eggert, S.L., Garcia-Callejas, D. …, Gauzens, B., 2026. Food web complexity underlies biodiversity effects on ecosystem functioning. Nature 1–7. https://doi.org/10.1038/s41586-026-10710-5

Begg, G.S., Cook, S.M., Dye, R., Ferrante, M., Franck, P., Lavigne, C., Lövei, G.L., Mansion-Vaquie, A., Pell, J.K., Petit, S., Quesada, N., Ricci, B., Wratten, S.D., Birch, A.N.E., 2017. A functional overview of conservation biological control. Crop Protection, Pesticide use and risk reduction with IPM 97, 145–158. https://doi.org/10.1016/j.cropro.2016.11.008

Bommarco, R., Vico, G., Hallin, S., 2018. Exploiting ecosystem services in agriculture for increased food security. Global Food Security 17, 57–63. https://doi.org/10.1016/j.gfs.2018.04.001

Carbonne, B., Muneret, L., Laurent, E., Felten, E., Ducourtieux, C., Henon, N., Matejicek, A., Chauvel, B., Petit, S., 2023. Conservation agriculture affects multitrophic interactions driving the efficacy of weed biological control. Journal of Applied Ecology 60, 1904–1916. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14475

Cardinale, B.J., Duffy, J.E., Gonzalez, A., Hooper, D.U., Perrings, C., Venail, P., Narwani, A., Mace, G.M., Tilman, D., Wardle, D.A., 2012. Biodiversity loss and its impact on humanity. Nature 486, 59–67.

Dainese, M., Martin, E.A., Aizen, M.A., Albrecht, M., Bartomeus, I., Bommarco, R., Carvalheiro,  …, Steffan-Dewenter, I., 2019. A global synthesis reveals biodiversity-mediated benefits for crop production. Science Advances 5, eaax0121. https://doi.org/10.1126/sciadv.aax0121

Jiménez-Albarral, J.J., Morán-López, T., Vitali, A., Illera, J.C., Miñarro, M., Hambäck, P.A., García, D., 2026. Birds and bats differ in pest control pathways in fruit orchards: Intraguild and direct predation. Journal of Applied Ecology 63, e70566. https://doi.org/10.1111/1365-2664.70566

Jonsson, M., Kaartinen, R., Straub, C.S., 2017. Relationships between natural enemy diversity and biological control. Current Opinion in Insect Science 20, 1–6. https://doi.org/10.1016/j.cois.2017.01.001

Martin, E.A., Dainese, M., Clough, Y., Báldi, A., Bommarco, R., Gagic, V., Garratt, M.P.D., … , Steffan‐Dewenter, I., 2019. The interplay of landscape composition and configuration: new pathways to manage functional biodiversity and agroecosystem services across Europe. Ecology Letters 22, 1083–1094. https://doi.org/10.1111/ele.13265

Martin, E.A., Reineking, B., Seo, B., Steffan-Dewenter, I., 2013. Natural enemy interactions constrain pest control in complex agricultural landscapes. Proceedings of the National Academy of Sciences 110, 5534–5539. https://doi.org/10.1073/pnas.1215725110

Petit, S., Muneret, L., Carbonne, B., Hannachi, M., Ricci, B., Rusch, A., Lavigne, C., 2020. Landscape-scale expansion of agroecology to enhance natural pest control: A systematic review. Advances in Ecological Research 63, 1–48. https://doi.org/10.1016/bs.aecr.2020.09.001

Rusch, A., Delbac, L., Thiéry, D., 2017. Grape moth density in Bordeaux vineyards depends on local habitat management despite effects of landscape heterogeneity on their biological control. Journal of Applied Ecology 54, 1794–1803. https://doi.org/10.1111/1365-2664.12858

Stage conventionné d’une durée de 6 mois minimum. Démarrage flexible à partir de janvier et jusqu’à mars 2027. 

Formations et compétences recherchées

• Formation recommandée : Etudiant.e en M2 dans le domaine de l’écologie (e.g. BEE) ou de l’agronomie avec spécialisation en agroécologie.
• Aptitudes recherchées : Bonne maitrise des logiciels SIG et R-Studio (notamment en statistiques inférentielles ; e.g. LMM, GLMM).
• Connaissances souhaitées : Des connaissances/compétences en écologie du paysage et/ou des communautés seraient appréciées. Des connaissances sur l’écologie d’au moins un des quatre principaux groupes taxonomiques seraient un plus (i.e. oiseaux, chauves-souris, carabes, araignées).
• Expérience appréciée : Première expérience en recherche et/ou analyse de données appréciées

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation