Stage : caractérisation protéomique et fonctionnelle des enzymes digestives de la mouche soldat noire

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein de l’Unité de Recherche Qualité des Produits Animaux (QuaPA) dans le cadre d’un projet de recherche impliquant 2 équipes de recherche de l’Unité : Imagerie et Transferts (IT), Micro-contaminants, Arômes et Sciences Séparatives (MASS) et la Plateforme d’Exploration du Métabolisme (PFEM). 

Les larves de mouche soldat noire (Hermetia illucens) suscitent un fort intérêt scientifique et industriel depuis plusieurs années en raison de leur potentiel pour la valorisation des coproduits végétaux et des biodéchets et la production durable de protéines destinées à l'alimentation animale. La compréhension des mécanismes digestifs mis en œuvre par ces insectes constitue un enjeu majeur pour optimiser leurs performances de bioconversion et mieux appréhender la biodisponibilité des nutriments.

Un premier modèle in vitro simulant la digestion chez la larve de mouche soldat noire a été proposé en 2020 (Gold et al., 2020). Cependant, cette approche repose sur un protocole dérivé du modèle Infogest développé pour la digestion humaine et ne prend pas en compte plusieurs spécificités physiologiques des insectes : composition réelle du cocktail enzymatique digestif, activités lipolytiques et autres hydrolases, modulation des temps de transit en fonction du substrat, rôle du microbiote intestinal ou encore variations des conditions physico-chimiques au sein du tube digestif. Ces limites s’expliquent au moins en partie par un manque actuel de connaissances quant à la physiologie digestive de la larve de mouche soldat noire (Bruno et al., 2025).

Votre mission consistera à poser les bases d'un modèle de digestion in vitro physiologiquement pertinent pour la mouche soldat noire en caractérisant les enzymes digestives présentes dans les différents compartiments de son tube digestif.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1. développer une méthodologie de dissection et de prélèvement des contenus digestifs des différents compartiments du tube digestif de Hermetia illucen ;
2. identifier les enzymes digestives présentes dans chaque compartiment par spectrométrie de masse ;
3. déterminer les principales activités enzymatiques (protéases, lipases, glycosidases, ...) associées à ces compartiments ;
4. établir une première cartographie fonctionnelle du système digestif de la larve de mouche soldat noire ;
5. fournir les bases biologiques nécessaires au développement futur d'un modèle de digestion in vitro spécifique aux insectes.

Méthodes utilisées : 

• dissection et prélèvement des compartiments digestifs de larves de Hermetia illucens ;
• optimisation des protocoles d'extraction des contenus digestifs ;
• préparation des échantillons pour analyses protéomiques ;
• identification des protéines par LC-MS/MS ;
• annotation bioinformatique des enzymes digestives ;
• mesure des activités enzymatiques à l'aide de tests colorimétriques ou fluorimétriques ;
• analyse et intégration des données protéomiques et fonctionnelles.

Date de prise de fonctions entre janvier et février 2027.

Formations et compétences recherchées

Connaissances souhaitées : Connaissances en biochimie, physiologie digestive et chimie analytique appréciées.

Expérience appréciée : Première expérience de stage en recherche.

Aptitudes recherchées : Rigueur, précision, esprit d’équipe.

Votre qualité de vie à INRAE

Le site de Theix situé à Saint-Genès-Champanelle est desservi par la ligne T2C numéro P39 ainsi qu’une ligne de transport à la demande, il est également équipé de stationnements et de services dédiés à la pratique du vélo.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation