Ingénieur-e d’étude en entomologie et imagerie scientifique

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l’Institut de recherche en santé des plantes de Montpellier (PHIM), une unité de recherche qui étudie les interactions entre les plantes, leurs bioagresseurs et leur environnement. Vous travaillerez dans un environnement interdisciplinaire réunissant des spécialistes de l’entomologie, de la biologie évolutive, de l’imagerie scientifique et de l’analyse de données.

Vous participerez à un projet exploratoire INRAE consacré à l’acquisition et à l’analyse d’images haute résolution d’insectes. Le projet vise à développer une méthode originale permettant de produire des images homogènes, comparables et exploitables pour des analyses scientifiques. La standardisation des acquisitions, la qualité des images et la traçabilité des données constituent des dimensions essentielles du projet.

Votre contribution permettra de constituer un ensemble de données d’imagerie fiable et reproductible pour l’étude des insectes. Vous travaillerez en lien étroit avec les entomologistes et les spécialistes de l’analyse des images afin d’adapter les protocoles aux besoins scientifiques du projet.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

1. Acquisition et traitement d’images scientifiques

• Préparer et manipuler les spécimens entomologiques.
• Réaliser des acquisitions d’images haute résolution avec un microscope numérique KEYENCE.
• Définir et ajuster les paramètres nécessaires à la standardisation des acquisitions.
• Traiter et préparer les images avec Adobe Photoshop ou un logiciel équivalent.
• Contrôler la qualité des images et reprendre les acquisitions si nécessaire.

2. Gestion, traçabilité et qualité des données (principes FAIR)

• Organiser, nommer, documenter et archiver les fichiers et les métadonnées associées.
• Assurer la traçabilité entre les spécimens, les informations taxonomiques, les acquisitions et les fichiers produits.
• Participer à la structuration, au stockage et au contrôle qualité des données.
• Veiller à la reproductibilité des protocoles et des séries d’images.
• Contribuer, selon vos compétences, à l’automatisation de certaines étapes du flux de données.

3. Travail collaboratif et amélioration des protocoles

• Échanger régulièrement avec les entomologistes et les spécialistes de l’analyse d’images du projet.
• Adapter les protocoles d’acquisition et de traitement aux besoins des analyses.
• Identifier et signaler les anomalies susceptibles d’affecter la qualité des données.
• Participer au suivi du projet et à l’amélioration des méthodes utilisées.

Après une phase de prise en main des protocoles, vous disposerez d’une autonomie importante dans l’organisation et la conduite des acquisitions.

Le poste implique la réalisation de séries importantes d’acquisitions d’images nécessitant un niveau élevé de précision, de régularité et de concentration.

Les travaux s’inscrivent dans un projet de recherche en cours. Une discrétion professionnelle stricte est attendue concernant les données, les protocoles, les analyses et les résultats non publiés.

Formations et compétences recherchées

Une formation en entomologie, systématique, biologie évolutive, écologie, sciences de la biodiversité ou dans un domaine proche est attendue.

Une expérience pratique de l’acquisition d’images scientifiques avec un microscope numérique KEYENCE est requise. Une expérience en taxonomie intégrative, en collections entomologiques, en imagerie de spécimens biologiques et dans la gestion du cycle de vie des données scientifiques sera appréciée.

Savoir-faire :

• Utiliser un microscope numérique KEYENCE pour l’acquisition d’images scientifiques.
• Préparer et manipuler des spécimens entomologiques.
• Traiter des images scientifiques avec Adobe Photoshop ou un logiciel équivalent.
• Maîtriser les principes de taxonomie et de systématique.
• Organiser, documenter et contrôler la qualité des données et des métadonnées scientifiques.
• Des compétences en bases de données, principes FAIR, R, Python ou automatisation de traitements seront appréciées.

Savoir-être :

• Rigueur, fiabilité et sens de l’organisation.
• Autonomie et capacité à gérer les priorités.
• Curiosité scientifique et intérêt pour les insectes et leur diversité.
• Capacité à travailler au sein d’un collectif interdisciplinaire.
• Réactivité face aux difficultés techniques.
• Respect de la confidentialité.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation