Ingénieur-e d’études en biochimie et microbiologie

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous rejoindrez l’unité de Recherche INRAE BIOlogie et GEstion des champignons phytopathogènes BIOGER (site web : https://bioger.versailles-saclay.hub.inrae.fr/), composante de l’Université Paris-Saclay, qui étudie les champignons pathogènes des plantes de grandes cultures (blé, colza) et de la vigne. Elle est localisée sur le campus AgroParisTech de Palaiseau (91) et regroupe 45 agents permanents (et une vingtaine de non-permanents) répartis dans cinq équipes de recherche, trois plateaux techniques (IMAFUN (IMAging plant-FUNgal and cytology), Production végétale et Bio-informatique/bioanalyse) et des « Services communs» (gestion-accueil, milieux-laverie). Vous intégrerez l'équipe GAIA (Gestion et Anticipation Intégrées de l'Adaptation des pathogènes fongiques) composée de 2 chercheurs, 3 ingénieurs, 1 technicien ainsi que plusieurs étudiants et CDD (https://bioger.versailles-saclay.hub.inrae.fr/equipes-et-plateaux/gaia-gestion-et-anticipation-integrees-de-l-adaptation-des-champignons-phytopathogenes).

Dans le cadre du projet ANR CONIDIA (https://anr.fr/Projet-ANR-25-CE35-2024), vous contribuerez à l’étude de nouveaux mécanismes impliqués dans la résistance des champignons phytopathogènes aux fongicides. Vos travaux porteront sur le champignon Zymoseptoria tritici et combineront des approches de biologie moléculaire, de biochimie, de génétique et d’analyse des données issues de plateformes spécialisées. Votre activité contribuera à mieux comprendre les mécanismes de résistance aux fongicides et les fonctions biologiques des protéines impliquées dans ces mécanismes. Vous travaillerez en interaction avec les différents membres du projet, sous la supervision de l’ingénieure de recherche responsable du projet ANR, ainsi qu’avec des plateformes d’analyse dans un environnement scientifique pluridisciplinaire. 

Dans ce cadre, vous serez en charge les activités suivantes :

1. Biologie moléculaire et microbiologie

- concevoir des amorces et réaliser des PCR et des clonages ;

- transformer des bactéries et champignons ;

- extraire l’ADN pour envoi aux plateformes de séquençage ;

- cultiver Z. tritici et assurer leur mise en collection ;

- générer des mutants de gènes candidats et réaliser des tests de résistance aux fongicides ;

- préparer les échantillons pour les analyses ChIP-seq, RNA-seq et Co-Immunoprécipitation.

2. Analyse, suivi et valorisation des résultats

- interpréter et rendre compte des analyses réalisées sur les plateformes ;

- collecter les résultats, les mettre en forme et en rendre compte ;

- assurer la traçabilité des analyses en coordination avec les scientifiques du projet;

- participer à la rédaction et mise en forme des résultats en vu de leur publication ;

- former des membres de l’équipe (stagiaires et étudiants) aux techniques utilisées ;

- participer aux réunions d’équipe, d’unité (lorsque pertinent et/ou nécessaire) et du projet ANR.

- missions transversales (suivi des stocks de consommables).

Des déplacements vers des plateformes d'analyse du réseau Saclay Plant Sciences et/ou vers les laboratoires de collaborateurs seront à prévoir. Le poste implique un travail avec des organismes génétiquement modifiés en milieu confiné, avec l’utilisation d’une sorbonne/hotte et/ou avec des équipements de protection selon les expérimentations. Le télétravail est possible, dans la limite d’un jour par semaine et si l’activité le permet.

Formations et compétences recherchées

Formation et compétences attendues :

Vous êtes titulaire d’un Master ou d’un diplôme d'ingénieur dans le domaine de la biochimie ou toute formation apportant des compétences similaires. Une expérience en microbiologie fongique et biologie moléculaire serait un plus.

Savoir-faire :

• Maitriser les principales techniques de biologie moléculaire et de biochimie, notamment ChIP-seq, Co-IP
• Préparer et conserver des échantillons biologiques
• Utiliser les outils informatiques nécessaires au traitement des données.
• Adapter les techniques d’analyse aux besoins expérimentaux.
• Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité liées à la manipulation des produits toxiques, des produits contaminants et des OGM.
• Rendre compte des résultats et transmettre ses connaissances.

Savoir-etre :

• Rigueur, fiabilité et soin. 
• Grand sens de l'organisation, capacité d'adaptation.
• Excellent sens relationnel et capacité d'interaction avec plusieurs interlocuteurs.
• Gout pour le travail en équipe et les environnements multidisciplinaires.
• Curiosité et ouverture d’esprit.

La maitrise de l’anglais au niveau B1 est attendue ; Permis B est fortement souhaité.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation