Analyse de la variabilité des poids de naissance des lapereaux en lien avec leur viabilité

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’unité GenPhySE(Génétique, Physiologie, et Systèmes d’élevages), une Unité Mixte de Recherche (UMR) INRAE-Université de Toulouse-ENVT située au sud de Toulouse. GenPhySE regroupe plus de 150 personnes travaillant sur des espèces animales d’élevages (porc, mouton, chèvre, lapin, caille, abeille). Vous serez intégré.e à l’équipe SESAME (Stratégies génétiques pour la multiperformance des systèmes d’élevage), en lien avec l’équipe MAGE (Multiperformance animale et génétique).

Contexte. L’amélioration de la survie des jeunes animaux est un enjeu crucial en élevage. La mortalité autour de la naissance peut être conséquente pour l’élevage de certains mammifères comme le porc ou le lapin, chez lesquels la taille des portées élevée s’accompagne d’une forte variabilité entre nouveau-nés, notamment en termes de poids de naissance. Chez le lapin, cette variabilité pourrait avoir des conséquences importantes sur la survie des lapereaux et, à terme, sur leurs performances d’élevage.

Des observations de terrain suggèrent que les lapereaux présentant un très faible poids à la naissance sont davantage exposés à une mortalité précoce et peuvent être considérés comme ayant de faibles perspectives de survie et de valorisation en élevage. Une meilleure compréhension des relations entre poids de naissance, survie et performances ultérieures apparaît donc nécessaire, notamment dans une perspective d’amélioration à la fois de la viabilité des animaux et du bien-être animal.

Objectif. L’objectif de ce stage sera d’étudier, à partir de données expérimentales, la variabilité du poids de naissance des lapereaux et son association avec leur durée de vie. Il s’agira notamment de déterminer s’il existe un niveau de poids à la naissance en dessous duquel la probabilité de survie et/ou de développement normal diminue fortement, et si un éventuel seuil de poids peut être identifié. 

À terme, ces résultats pourraient contribuer à définir des critères objectifs de viabilité des nouveau-nés et à identifier des leviers permettant de réduire la mortalité néonatale en élevage cunicole, tout en conciliant performances de production, efficacité économique et bien-être animal.

Travail envisagé. Analyse génétique de la variabilité du poids de naissance en lien avec l’analyse de survie des lapereaux à l’aide de R et de logiciels dédiés. A l’issue du stage l’étudiant(e) aura acquis des compétences sur l’estimation des paramètres génétiques et renforcé sa maitrise de R pour l’analyse des fichiers de données.

Le stage aura lieu sur site, en présentiel uniquement, sur le campus INRAE Occitanie-Toulouse d’Auzeville, au sud de Toulouse. Le campus est accessible en transport en commun (Tisseo L6) depuis Toulouse. Il est situé à proximité du canal du midi, permettant un accès vélo privilégié.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : génétique statistique, génétique quantitative ou bioinformatique ; ingénieur agronome/agricole

Connaissances souhaitées : Bonnes connaissances et goût pour la programmation et les statistiques avec R.

Expérience appréciée : manipulation et analyse de données

Aptitudes recherchées : Capacités de synthèse, rédaction, écoute, rigueur, organisation, disponibilité et autonomie.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation