Ingénieur.e de recherche en Biostatistique / Écologie quantitative appliquée à l’estimation des abondances des espèces animales sauvages

Retour à la liste des résultats

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein du Laboratoire ÉcoSystèmes et Sociétés En Montagne (LESSEM), un laboratoire interdisciplinaire de INRAE qui étudie le fonctionnement et la dynamique des socio-écosystèmes, notamment en montagne. 

Vous intégrerez l’équipe DYNAMICS (Dynamique et gestion durable des écosystèmes terrestres dans un contexte de changement global), dont l’objectif est de développer des connaissances et des outils (ex. modèles, méthodes, indicateurs…) pour comprendre et prédire la dynamique de communautés ou d’écosystèmes terrestres, en particulier les forêts de montagne. Plus précisément, vous travaillerez sur le développement et évaluation d’un nouveau protocole de suivi de terrain pour estimer les abondances de gélinotte des bois. 

Le projet, financé dans le cadre de la coopération entre l'OFB (DRAS / S-AFET) et INRAE, s’inscrit dans l'étude de l'impact des activités humaines sur le comportement et la démographie des galliformes de montagne (gélinotte des bois, grand tétras).

L'estimation de l'abondance des espèces discrètes ou peu accessibles est essentielle à leur conservation. Ce projet vise à concevoir, évaluer et tester sur le terrain un nouveau protocole d'échantillonnage par transects basé sur des indices de présence indirects (fèces, empreintes). L'évaluation des estimateurs reposera sur des simulations informatiques intégrant des mouvements d'animaux (issus de suivis GPS modélisés par LiDAR/SSFs), la dynamique de déposition/dégradation des fèces et les déplacements des observateurs. Des données de fèces génotypées déjà existantes serviront de référence (modèles SECR).

Vous serez en charge de :

• Analyse de données de référence : Estimer la densité des populations à partir des données génotypées existantes (modèles de capture-recapture spatialement explicites - SECR).
• Développement méthodologique : Formaliser des méthodes d'échantillonnage et des estimateurs d'abondance adaptés aux indices non génotypés.
• Modélisation et Simulation : Évaluer et valider les estimateurs via des simulations spatio-temporelles complexes (déplacements des animaux et des observateurs, déposition/dégradation des indices).
• Expérimentation sur le terrain : Déployer et coordonner la mise en œuvre du protocole sur au moins un site d'étude pour confronter les résultats simulés aux données de terrain.
• Valorisation et Transfert : Package/code R structuré pour l'analyse automatisée des données. Rédaction d’un rapport techniques et d’un article scientifique. Restitution et formation auprès des partenaires de terrain (OFB, gestionnaires).

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Doctorat ou Master/Diplôme d'ingénieur avec une spécialisation marquée en Biostatistique ou Écologie quantitative.

Connaissances souhaitées :

• Biostatistique & Écologie numérique : Solides compétences en modélisation démographique et spatiale (ex. Spatial Capture-Recapture, Occupancy models).
• Programmation & Modélisation : Maîtrise experte du langage R (développement de scripts propres, création de packages) et de la simulation de processus spatio-temporels.
• Des connaissances en écologie du paysage seraient un plus.

Une expérience professionnelle sur un poste similaire est appréciée.

Aptitudes recherchées : 

• Rigueur scientifique et esprit d’analyse,
• Autonomie, curiosité, capacité à travailler en équipe…

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation