Mécanismes biologiques associés à la résistance aux altérations physiologiques de la banane : approche intégrative du métabolisme et de la structure des tissus externes du fruit

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité entre les laboratoires de l’UMR Qualisud (site La Réunion https://www.banaplus.org/sites/reunion) et le laboratoire UR BIA (Nantes) https://ur-bia.angers-nantes.hub.inrae.fr/. Elle sera basée à la Réunion et nécessitera des déplacements à BIA. 

Financement  acquis dans le cadre du projet PARSADA BANA+ https://umr-qualisud.cirad.fr/principaux-projets/bana-accelerer-le-developpement-de-varietes-de-bananiers-resistants-aux-maladies-fongiques-pour-reduire-l-usage-des-persticides-aux-antilles-et-dans-les-autres-droms

Dans le cadre de cette thèse, votre mission consistera à identifier les mécanismes biologiques associés à la résistance aux altérations physiologiques de la banane en combinant une approche intégrative du métabolisme et de la structure des tissus externes du fruit.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1. Analyser l’évolution au cours de la maturation des métabolites impliqués dans les meurtrissures et le brunissement de manipulation de variétés ayant des traits de qualité fonctionnelle contrastés Une première approche consistera à réaliser une analyse comparative de variétés sensibles et résistantes aux brunissements et aux stress mécaniques, à différents stades de maturation. L’objectif sera d’identifier les signatures métaboliques associées à la tolérance, ainsi que les voies biochimiques impliquées dans la régulation de la réponse du fruit. Cette stratégie s’appuiera notamment sur les connaissances acquises dans d’autres modèles fruitiers (Park et al., 2026; Di Guardo et al., 2013 ; Wang et al., 2021) concernant le rôle du métabolisme cuticulaire, des composés phénoliques et des systèmes antioxydants dans la maîtrise du brunissement. 
2. Analyser et comparer l’organisation structurale du péricarpe  des variétés résistantes et sensibles au brunissement dans différentes conditions de conservation. Cette étude impliquera des approches par microscopie couplée à des analyses d’images d’une part et par des analyses biochimiques/spectroscopiques des constituants du péricarpe d’autres part. L’objectif étant de mieux caractériser les assises cellulaires et notamment les cires et  le continuum paroi-cuticule de l’épiderme à l’origine de cracks en surface et des brunissements.
3. Caractériser les propriétés thermo-mécaniques des matrices lipidiques et polysaccharidiques, afin de relier les propriétés physiques des tissus à leur sensibilité aux contraintes mécaniques. 

Originalité et perspectives

Cette approche multidisciplinaire permettra pour la première fois de relier les changements métaboliques, structuraux et mécaniques du fruit au cours de la maturation afin d’identifier les facteurs déterminant sa robustesse. Les résultats attendus contribueront à proposer de nouveaux marqueurs de sélection pour l’amélioration variétale du bananier et à concevoir des stratégies innovantes pour réduire les pertes post-récolte dans une perspective de production agroécologique.

 

Contacts  pour candidater

Joindre CV, lettre, et coordonnée de personnes référentes

Mathieu LECHAUDEL mathieu.lechaudel@cirad.fr

Bénédicte BAKAN benedicte.bakan@inrae.fr

Anne-Laure CHATEIGNER-BOUTIN anne-laure.chateigner-boutin@inrae.fr

Début de la thèse oct – nov 2026 

 

• Barral B., Chillet M., Lechaudel M., Lugan R., Galindo S. 2019. Coumaroyl-isocitric and caffeoyl-isocitric acids as markers of pineapple fruitlet core rot disease. Fruits, 74 (1): 11-17.
• Biabiany S., Araou E., Cormier F., Martin G., Carreel F., Hervouet C., Salmon F., Efile J-C, Lopez-Lauri F., D’Hont A., Léchaudel M., Ricci S. 2022. Detection of dynamic QTLs for traits related to organoleptic quality during banana ripening. Scientia Horticulturae, 293 110690..  https://doi.org/10.1016/j.scienta.2021.110690
• Lechaudel M., Darnaudery M., Joet T., Fournier P., Joas J. 2018. Genotypic and environmental effects on the level of ascorbic acid, phenolic compounds and related gene expression during pineapple fruit development and ripening. Plant Physiology and Biochemistry, 130:127-138.
• Hélène Rogniaux, Claire Mayer-Laigle, Alessia Melelli, Reine Barbar, Marie-Joo Le Guen, Stefan Hill, Hayden Thomas, Pierre Ouagne, Baptiste Buet, Bastien Annic, Isabelle Capron, Bénédicte Bakan, Estelle Bonnin, Anne-Laure Chateigner-Boutin, Mathilde Francin-Allami, Axelle Bouder, Lèna Brionne, Lucie Le Bot, Sofiane Guessasma, David Ropartz, Johnny Beaugrand (2026) Multicriteria physico-chemical analysis of flax technical fibres from drought-stressed plants: a case study highlighting plant compensatory responses. Industrial Crops and Products 246:123399 DOI: 10.1016/j.indcrop.2026.123399
• Nicolas Reynoud, Johann Petit, Cécile Bres, Marc Lahaye, Christophe Rothan, D Marion, B Bakan. The Complex Architecture of Plant Cuticles and Its Relation to Multiple Biological Functions. Frontiers in Plant Science, 2021, 12, https://dx.doi.org:10.3389/fpls.2021.782773.

• Anne-Laure Chateigner-Boutin, Fabienne Guillon, and Marie-Francoise Devaux (2025). Exploring the structural variability in developing wheat grains using autofluorescence multispectral imaging at the macroscopic scale. Front. Plant Sci. 16:1580426. doi: 10.3389/fpls.2025.158042

   

Merci de transmettre une lettre de motivation et un CV.

Mathieu LECHAUDEL mathieu.lechaudel@cirad.fr

Bénédicte BAKAN benedicte.bakan@inrae.fr

Anne-Laure CHATEIGNER-BOUTIN anne-laure.chateigner-boutin@inrae.fr; Bastien BARRAL-ext <bastien.barral@cirad.fr>

Date limite pour postuler : 20 Août 2026

 Thèse sur deux sites (ile de La Réunion et Nantes) 

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Master 2 ou d’un diplôme équivalent dans les domaines de la biologie végétale, ou de la biochimie.

Le ou la candidat(e) devra montrer un intérêt pour les recherches interdisciplinaires à l’interface entre sciences du végétal, et de la Biochimie. Une expérience en travail sur matériel végétal, microscopie, analyse d’images, caractérisation mécanique des matériaux ou analyses statistiques sera appréciée. De bonnes capacités d’organisation, de communication scientifique et d’interaction avec des partenaires de culture scientifiques différentes sont attendues. Une bonne maîtrise de l’anglais est requise ; la connaissance du français constituera un atout.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation