Post-doctorant-e sur l’édition génomique de la vigne H/F

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-eau sein de l’UMR Agroécologie du Centre INRAE de Dijon, dans le pôle interactions plantes microorganismes, au sein de l’équipe « Immunité de la vigne » codirigée par Marielle Adrian et Benoit Poinssot. La vigne est soumise à de nombreux agents pathogènes tels que Plasmopara viticola (mildiou), Erysiphe necator (oïdium) ou Botrytis cinerea (pourriture grise) qui causent des pertes importantes, conduisant à une usage massif de produits chimiques pouvant nuire à la santé humaine et à l’environnement. Pour accompagner la transition agroécologique, les stratégies alternatives misent sur de nouvelles variétés de vignes résistantes, l’utilisation de biomolécules comme « stimulateur de défense des plantes » (SDP) et l’exploitation des communautés microbiennes associées aux plantes. Cependant, l’érosion des gènes de résistance et l’émergence de maladies secondaires ont été observées sur des variétés de vigne obtenues par sélection classique. De plus, même si l’utilisation de SDP montre des résultats prometteurs au laboratoire, son efficacité reste encore limitée dans le vignoble. Néanmoins, l’utilisation de ces stratégies reste porteuse d’espoir puisque l’édition génomique pourrait les accélérer en ciblant les gènes impliqués dans les interactions plantes-micro-organismes. Dans ce contexte, le projet VINEDITING vise à obtenir des variétés de vigne éditées NGT1 avec des traits bénéfiques adaptés à la transition agroécologique. Pour obtenir une résistance aux agents pathogènes, nous ciblerons plusieurs gènes candidats identifiés à Dijon et Colmar. Les plantes éditées seront suivies pour leur résistance à un large panel de pathogènes cryptogamiques afin de produire des plantes avec une tolérance accrue et limitant ainsi l’émergence de maladies secondaires. Au-delà de l’évaluation de la résistance aux maladies, nous évaluerons également l’impact de l’édition sur les interactions avec des champignons bénéfiques. Enfin, nous quantifierons l’efficacité des SDP sur les plantes éditées afin d’obtenir de nouvelles variétés de vigne adaptées aux solutions agroécologiques.

Vous serez plus particulièrement en charge de la :

• Réalisation de constructions de biologie moléculaire pour cibler des gènes candidats et pour réaliser leur édition génomique chez la vigne
• Transformation de cals embryogènes et régénération de plantules puis multiplications végétatives par culture in vitro
• Réalisation de biotests de pathogénie ou de symbiose sur les lignées de vigne obtenues avec le mildiou, Botrytis ou des champignons bénéfiques
• Réalisation d'expériences de Biochimie et de Biologie Moléculaire visant à étudier les réactions de défense de la vigne à des MAMPs ou lors d’interactions plantes microorganismes
• L'aide au Management du projet ANR PEPR SVA VINEDITING, gestion des données et du Plan de Gestion des Données en collaboration avec les autres partenaires

 

Expérimentation en laboratoire de confinement niveau L2

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Master en Biologie et Doctorat en Biologie Végétale

Connaissances souhaitées : Biologie Moléculaire, Bioinformatique, Biochimie, Microbiologie, Phytopathologie

Expérience appréciée : Avoir déjà réalisé de l’édition génomique sur la vigne

Aptitudes recherchées : Gestion et management de projet, autonomie dans le design et la réalisdation d’expériences biologiques, rédaction de rapports et d’articles scientifiques, présentations orales en français et anglais

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation