Proposition de thèse VERS DE NOUVEAUX PROBIOTIQUES POUR UN VIEILLISSEMENT EN BONNE SANTE : IDENTIFICATION ET CARACTERISATION DE SOUCHES MICROBIENNES PROTECTRICES CONTRE LES STRESS CELLULAIRES LIES AU VIEILLISSEMENT

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Laboratoires d’accueil  

Equipe « Œil & Nutrition », de l'UMR  « Centre des Sciences du Goût et de l’Alimentation » (CSGA), Dijon 

Equipe « Aliment, Fermentation, Interaction, Microbiote » de l’UMR « Procédés Alimentaires et Microbiologiques » (PAM), Dijon

Sujet

Le projet ANR MICROFOODING vise à développer un modèle in vitro de criblage de souches microbiennes (bactéries et levures) issues d’aliments fermentés végétaux, afin d’identifier celles capables de favoriser un vieillissement en bonne santé. La thèse portera sur le développement et l’optimisation d’un outil de criblage en microscopie confocale basé sur l’utilisation d’une lignée cellulaire rapportrice de l’autophagie, processus clé du maintien de l’homéostasie cellulaire et de la protection contre le vieillissement, permettant de sélectionner parmi 100 souches celles présentant l’activité la plus marquée. Les souches retenues seront ensuite validées dans des modèles cellulaires plus complexes mimant le dialogue entre l’épithélium intestinal et d’autres compartiments cellulaires, puis testées in vivo en cocktail en collaboration avec l’équipe ProbiHôte de l’INRAE de Jouy-en-Josas.

Cette thèse, financée par l’ANR et le département INRAE AlimH sera réalisée à l’interface entre l’équipe « Œil & Nutrition » de l’UMR CSGA et l’équipe AFIM de l’UMR PAM.

Encadrants : Marie-Agnès Bringer (UMR CSGA) et Pierre Lapaquette (UMR PAM) 

Formations et compétences recherchées

Profil souhaité du/de la candidat(e)

■   être titulaire d’un Master 2 en Microbiologie

■ avoir des connaissances et compétences techniques en microbiologie, microbiologie cellulaire, culture cellulaire, microscopie confocale, développement de macros sous ImageJ. Des connaissances théoriques et pratiques sur le mécanisme d’autophagie et l’analyse de son activité seront un plus. 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Les candidats sont priés d’envoyer un CV scientifique détaillé ainsi qu’un court message de motivation et une lettre de recommandation de leur encadrant de stage M2.

Contacts : marie-agnes.bringer@inrae.fr et pierre.lapaquette@ube.fr (merci de bien envoyer vos candidatures aux deux encadrants)