Ingénieur-e pour l’Elaboration d’un Outil d’Aide à la Décision pour le suivi des insectes ravageurs de la luzerne porte-graine

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

L'Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS) est une Unité Mixte de Recherche (UMR 1345) sous les tutelles de l’INRAE, l'Institut Agro Rennes-Angers et l'Université d'Angers.

La Fédération Nationale des Agriculteurs Multiplicateurs de Semences (FNAMS) est une organisation professionnelle chargée de représenter les intérêts des agriculteurs multiplicateurs et d’élaborer des références techniques en production de semences.

 

Environnement de travail, missions et activités

La multiplication de semences de luzerne (Medicago sativa L.) est la première, en termes de surface (environ 19 000 ha en 2025), au sein de la production fourragère française. Or, cette culture est sujette à des attaques de nombreux insectes ravageurs qui peuvent réduire la quantité et la qualité des semences de luzerne produites. 

Un réseau de bio-surveillance est conduit chaque année pour fournir aux producteurs des données d’infestations en parcelles, ces données permettant de raisonner les traitements insecticides réalisés. A cet effet, une carte interactive en ligne des résultats de suivis en parcelles est déjà disponible sur le site internet de la FNAMS. Cependant, les comptages des ravageurs au champ sont chronophages. De plus, l’identification de ces insectes par des observateurs de terrain inexpérimentés peut conduire à des erreurs de dénombrement et donc d’intervention. 

Afin d’améliorer la qualité des observations et de réduire le temps passé au dénombrement, un outil de comptage automatique des insectes sur photos prises au champ est en cours d’élaboration. Il doit permettre de faire des estimations de pressions de ravageurs rapides et fiables, et il doit être en lien avec la carte en ligne déjà disponible pour une diffusion optimisée des résultats du réseau de suivi.

La mission proposée s’intègre dans le projet COLEOFAST du plan PARSADA, porté par la FNAMS.

Objectifs de la mission

Reprendre l’algorithme de comptage automatique préexistant et le finaliser.

A partir de l’algorithme, développer une application smartphone de comptage automatique.

Mettre à jour l’outil de carte en ligne déjà disponible sur le site FNAMS.

Elaborer la mise en lien des deux outils (application smartphone comptage et carte en ligne).

Assurer des formations à l’utilisation de l’outil complet pour les utilisateurs de terrain (conseillers, agriculteurs, etc.).

Détail des actions

• Mise à jour de l’algorithme de comptage YOLO à partir de nouvelles photos annotées
• Analyse fine des images présentant des divergences fortes entre le comptage de terrain et le comptage par l’algorithme
• Validation finale de la fiabilité des annotations manuelles sur photo par rapport aux comptages directement sur le terrain
• Validation finale de la fiabilité des prédictions de comptages par l’algorithme par rapport aux comptages par annotations manuelles sur photo
• Programmation d’une application smartphone avec l’aide d’un ingénieur INRAE en définissant l’architecture (base de stockage des données, hébergement de l’algorithme, etc.)
• Refonte de l’outil carte en ligne construit sur un modèle d’application R Shiny, notamment en lien avec l’application de comptage
• Validation finale de l’outil complet en mettant à l’épreuve sur le terrain avec une équipe de bêta-testeurs
• Construction et dispense d’une formation pour les utilisateurs

La personne recrutée sera basée à l’IRHS - équipe ImHorPhen - de Beaucouzé (49070), avec des déplacements ponctuels éventuels au centre technique de la FNAMS à Brain-sur-l'Authion (49800).

Formations et compétences recherchées

Profil recherché

Bac+5 en cursus mathématique ou agronomie, ayant une maîtrise ou un intérêt pour les outils d’analyse d’images et la modélisation mathématique appliqués à l’agriculture. Une affinité pour l’entomologie est un plus

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation