Chargé-e de recherche : Vaccins à large spectre contre le virus de la fièvre catarrhale ovine (BTV) et mécanismes moléculaires

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein de l'UMR Virologie, une unité mixte de recherche INRAE-Anses-EnvA composée d'une cinquantaine de personnes répartie en cinq équipes de recherche et située sur le campus de l'Ecole nationale vétérinaire d'Alfort (EnvA), à Maisons Alfort. Vous intégrerez l'équipe Interfaces Virus-Hôtes et Thérapeutiques au sein du groupe qui développe la thématique des mécanismes moléculaires qui influencent la réplication d'orbivirus et leur transmission. 

Votre mission consistera à prendre en charge un projet de recherche qui vise à : (i) développer des vaccins à large spectre, basés sur des protéines recombinantes, contre le virus de la fièvre catarrhale ovine (bluetongue virus, BTV) et évaluer ces vaccins dans un modèle rongeur ; (ii) étudier les mécanismes sous-jacents d'une facilitation de l'infection par le virus, liée à l'existence de nombreux sérotypes viraux ; et (iii) étudier les interactions virus-cellules, notamment certains mécanismes qui affectent la réplication et en particulier l'investigation du rôle de nouvelles protéines virales (récemment identifiées) dans la réplication d'orbivirus (modèles cellulaires), et leur rôle potentiel en tant que sous-unités vaccinales. Vous mettrez en place les approches méthodologiques nécessaires pour assurer le succès du projet de recherche.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1. Construire les plasmides nécessaires à l'expression de protéines recombinantes. Exprimer un grand nombre de protéines de capside de BTV dans les plantes, purifier ces protéines et les utiliser pour immuniser des rongeurs afin de préparer des anticorps. Cartographier les relations antigéniques entre les différentes protéines et investiguer les liens de neutralisations croisées.
2. Définir et investiguer des combinaisons de protéines virales afin d'identifier celles qui assurent une protection à large spectre (vis-à-vis des divers sérotypes de BTV). Collaborer avec nos partenaires pour la formulation des protéines virales avec des nano-carriers. Investiguer les préparations dans le modèle souris et chez les ovins. Investiguer le phénomène de facilitation de l'infection par le BTV en présence d'anticorps et identifier les mécanismes sous-jacents. 
3. Etudier la structure atomique des protéines virales exprimées en collaboration avec des biologistes structuraux. Etudier le rôle de nouvelles protéines virales (découvertes récemment) dans la réplication/transmission (études biochimiques, pull-down de complexes protéiques et leurs caractérisations, interaction avec les voies métaboliques) et générer des virus défectifs, par génétique inverse, pour ces protéines.
4. Maintenir diverses lignées cellulaires nécessaires pour la réalisation du projet (cellules de mammifères et arthropodes). Analyser les données issues des recherches que vous mènerez, synthétiser ces résultats et les présenter lors des réunions de l'UMR, auprès des collaborateurs et dans les congrès scientifiques. 

Travailler avec des pathogènes en milieu confiné (NSB2, NSB3). Travailler en milieu confiné avec des animaux d'expérimentation (A3). Déplacement sur le territoire national pour la production des protéines et à l'étranger pour interagir/collaborer avec nos partenaires, en particulier au Royaume Uni. Permis de conduire nécessaire. 

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : doctorat en virologie ou équivalent

Connaissances souhaitées : Une connaissance de la virologie et de la biologie cellulaire et moléculaire est nécessaire. Manipulation des virus animaux en milieux confinés (NSB2 et NSB3, A3) ; expression et purification de protéines dans les systèmes de plantes (indispensable) ; biochimie des protéines ; développement et évaluation de vaccins à base de protéines recombinantes (indispensable) ; connaissance des modèles animaux ; génétique inverse des virus ARN. Une expérience dans le domaine d’interactions virus-hôtes et voies de signalisations cellulaires impliquées dans la réplication des virus est vivement souhaitée.

Expérience appréciée : Une expérience avec les arbovirus est un atout. Expérience avec divers systèmes d'expressions de protéines ; analyses bio-informatiques ; manipulations et analyses d'échantillons biologiques issus d'expérimentations animales ; purification de protéines par chromatographie d'affinité ; génétique inverse des virus à génomes ARN double-brins. 

Aptitudes recherchées : Capacité à travailler en équipe, en autonomie et à collaborer avec des chercheurs issus de disciplines variées incluant la virologie (arbovirologie), la biologie structurale et l'expérimentation animale ; aptitude à produire et soumettre des publications dans des revues scientifiques ; très bonne maîtrise de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit (publications scientifiques, participations à des congrès, interactions avec les collaborateurs internationaux). 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation