Variabilité temporelle des effets de l’exposition embryonnaire du médaka japonais (Oryzias latipes) aux eaux de la frayère de la grande alose (Alosa alosa) à Golfech (Garonne) et conséquences sur le développement et la reproduction.

Retour à la liste des résultats

Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de l’unité de recherche Écosystèmes aquatiques et changements globaux (EABX) qui s’intéresse aux réponses de la biodiversité aquatique estuarienne et continentale aux changements globaux. L’équipe Fonctionnement et Restauration des Ecosystèmes Estuariens et des populations de Migrateurs Amphihalins (FREEMA) dans laquelle vous effectuerez votre doctorat s’intéresse au fonctionnement des écosystèmes estuariens et de certaines populations d’intérêt patrimonial (poissons migrateurs). 

Cette thèse vise à évaluer les effets à long terme d’une exposition embryonnaire à des eaux de rivière potentiellement contaminées en utilisant un dispositif expérimental ex situ (Bancel et al., 2025) et un poisson modèle, le médaka japonais (Oryzias latipes), en combinant des marqueurs morphométriques, physiologiques et comportementaux. Choisi comme espèce modèle, le médaka permet d’évaluer de manière pertinente les risques écotoxicologiques affectant la grande alose (Alosa alosa), espèce migratrice en danger critique d’extinction. D’après Bancel (2025), ces deux espèces présentent une sensibilité similaire face à la toxicité de l’eau de la Garonne, en particulier sur la frayère de Golfech.

Elle s’articule autour de deux axes complémentaires : (1) la caractérisation de la toxicité saisonnière des eaux et (2) l’étude des effets différés de cette exposition précoce sur le développement et la reproduction des individus.

Le premier axe explore la variabilité saisonnière de la toxicité en exposant en conditions contrôlées et en continu des embryons de médaka aux eaux de la frayère de Golfech à différentes périodes de l’année (printemps, été, automne) et à différentes dilutions (25 %, 50 % et 100 %). La survie, le développement des embryons seront suivis tous les jours. Des tests écotoxicologiques normalisés (bioaccumulation et toxicité chez le gammare) et des analyses chimiques ciblées (via échantillonneurs passifs) permettront de caractériser finement la qualité du milieu.

Le second axe se concentre sur les conséquences à long terme de cette exposition durant le développement embryonnaire, en maintenant et suivant les individus jusqu’à l’âge adulte dans des conditions contrôlées et non contaminées. Leur croissance, leur métabolisme (respirométrie), leur comportement (nage, activité) et leur succès reproducteur seront évalués pour identifier des effets sublétaux susceptibles d’altérer la dynamique des populations, notamment chez les espèces migratrices.

En parallèle, des collaborations avec des étudiants en Master enrichiront cette étude via des analyses moléculaires (lipidomique, protéomique et transcriptomique) destinés à évaluer les effets métaboliques de l’exposition. Ces approches complémentaires permettront de mieux comprendre les mécanismes sous-jacents aux impacts observés. À terme, ces résultats fourniront des données clés pour la gestion environnementale des milieux contaminés, en particulier pour les frayères critiques comme celle de Golfech.

Plus d’information sur le site de l’école doctorale Sciences et Environnements : 

https://adum.fr/as/ed/voirproposition.pl?langue=&site=ed_se&matricule_prop=70215

Travail de terrain et travail de laboratoire

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Master en écologie, écotoxicologie ou biologie aquatique

Connaissances souhaitées : Connaissances en écophysiologie, écotoxicologie et écologie, avec une bonne compréhension des interactions entre organismes et environnement.

Expérience appréciée : Capacité à travailler dans des conditions parfois exigeantes (terrain et laboratoire), esprit d’initiative et de résolution de problèmes et aptitude à travailler en équipe dans un contexte collaboratif pluridisciplinaire.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective ;

-d'une prise en charge partielle abonnement domicile/travail (TER, TBM).

Modalités pour postuler

 Vous devez postuler directement sur le site de l’école doctorale Sciences et Environnements :  https://adum.fr/as/ed/voirproposition.pl?langue=&site=ed_se&matricule_prop=70215