Doctorat : Biodisponibilité et effets combinés glyphosate et du cuivre sur les biofilms d’eau douce

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein d'EABX, une unité de recherche en écologie aquatique qui mène des activités sur la caractérisation et la compréhension des réponses de la biodiversité aquatique continentale (cours d’eau, lacs et estuaires) aux changements globaux à différentes échelles biologiques, spatiales et temporelles. Parmi les 2 équipes de recherche constitutives de EABX, les travaux de l’équipe ECOVEA (Écologie des COmmunautés VEgétales Aquatiques et impact des pressions multiples) sont centrés sur la connaissance de la biodiversité et du fonctionnement des communautés végétales (macrophytes, phytoplancton, phytobenthos) d’eaux douces, ainsi que sur leurs réponses aux perturbations naturelles et anthropiques. De façon synthétique, les activités de recherche de l’équipe s’articulent autour des thématiques suivantes : évaluation de l’exposition aux contaminants, impact des altérations des hydrosystèmes sur les communautés végétales à différents niveaux d’organisation biologique, biodiversité, vulnérabilité et adaptation aux changements globaux.

Par ailleurs, c’est parmi l’équipe ECOVEA qu’un sujet de thèse est proposé à partir de la rentrée 2026, concernant la biodisponibilité et effets combinés glyphosate et du cuivre sur les biofilms d’eau douce. Le glyphosate, un herbicide courant, est souvent utilisé avec la bouillie bordelaise en agriculture, entraînant une pollution simultanée des eaux par le glyphosate et le cuivre. Les études montrent jusqu’ici des conséquences et impacts variés, parfois contradictoires, de cette double contamination sur l'environnement. Considéré isolément, le cuivre est toxique pour les micro-organismes des biofilms périphytiques, essentiels pour l'équilibre des écosystèmes aquatiques, induisant par exemple du stress oxydatif ou encore en modifiant leur structure. Le glyphosate peut également impacter directement les communautés au sein des biofilms, toutefois, un rôle moins documenté de celui-ci porte sur ses propriétés chélatantes vis-à-vis des métaux. Il peut en effet moduler la disponibilité des nutriments et des métaux lourds dans les sols et les milieux aquatiques. 

Afin d’aller plus loin dans la compréhension de ce type de pollutions complexes et en mélange, il est suggéré, dans le cadre de ce travail de thèse, d'examiner le comportement du glyphosate et de l'AMPA, principal métabolite, en présence d'un métal comme le cuivre, en tenant compte à la fois des aspects physico-chimiques (complexation, compétition avec d'autres ligands, notamment la MOD) et des impacts globaux sur la communauté de biofilms d'eau douce.

Objectifs :

• Il s’agit d’aborder les impacts combinés du cuivre et du glyphosate utilisés en tant que pesticides ;
• puis d’accroitre la complexité du milieu d’exposition avec l’introduction de matière organique et/ou d’autres ligands qui pourraient rentrer en compétition ;
• enfin, la biodisponibilité du métal serait abordée via des aspects toxicocinétiques (i.e. bioaccumulation) et toxicodynamique (i.e. structure de la communauté, fonctions et réponses adaptatives) en fonction de ses interactions avec les différents agents chélatants

Conditions d’activité : 

Laboratoire biomarqueurs de l’UR EABX : Chromatographie ionique, analyseur élémentaire, LC-MS/MS

Pôle végétaux aquatiques de l’UR EABX : Canaux et microcosmes, fluorimètres (Phyto-PAM, Imaging-PAM)

Equipe biogéochimie des nutriments et des éléments traces de l’UMR ISPA (unité partenaire) : technique séparative basée sur membrane à échange de cations, ICP optique.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Le/la candidat.e recherché.e sera titulaire d’un Master 2 ou d’un diplôme d’ingénieur.e en chimie analytique. 

Des connaissances dans le domaine de l’écotoxicolgie seraient un plus appréciable.

Aptitudes recherchées : Le/la candidat.e devra faire preuve d’autonomie tout en sachant s’entourer pour mener à bien son projet. 

De bonnes bases en anglais sont indispensables comme le/la candidat.e sera amené.e à interagir avec des collègues étranger.ères lors de conférences ou, plus régulièrement, dans la réalisation des différents volets de la thèse.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective ;

-d'une prise en charge partielle abonnement domicile/travail (TER, TBM).

Modalités pour postuler

Les candidatures se font exclusivement via le portail ADUM : https://adum.fr/as/ed/voirproposition.pl?site=adumR&matricule_prop=69903

Il est toutefois possible de contacter les encadrants Soizic MORIN et Nicolas MAZZELLA DI BOSCO par e-mail