Post-doctorant.e en génétique de la résistance des Brassica à la grosse altise

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l'équipe DEBI (Diversité et Évolution des Interactions Biotiques) de l'UMR IGEPP (Le Rheu, France). Cette équipe interdisciplinaire mobilise des expertises en biologie moléculaire, métabolomique, génomique fonctionnelle, ainsi qu'en génétique quantitative et des populations. Le projet scientifique de ce post-doctorat s’inscrit dans le cadre du projet européen HORIZON Europe – PROWILD, qui vise à explorer et valoriser la diversité génétique des apparentés sauvages (Crop Wild Relatives) du blé, de la betterave et des Brassica. Votre mission se concentrera sur le genre Brassica.

L'enjeu majeur est de répondre aux défis de la filière colza en identifiant des leviers de lutte durable contre la grosse altise, l'un des principaux ravageurs des cultures d'hiver. Alors que la résistance à cet insecte varie peu au sein d'une même espèce, elle est très contrastée entre les espèces : les choux, navets et colzas présentent des niveaux de défense très différents. Le chou, bien que la variante sauvage directe est inconnue, s'avère naturellement plus résistant que le colza. L'objectif de vos travaux sera de : retracer l’histoire évolutive des choux sauvages, caractériser leur spectre de résistance à la grosse altise, et déterminer si cette résistance est corrélée à la proximité génétique avec les espèces domestiquées.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• organiser et mener des expérimentations au champs pour évaluer le niveau de résistance des 70 populations. 
• organiser des échantillonnages pour tester les hypothèses démographiques quant aux origines des choux. 
• associer les phénotypes aux données génétiques à acquérir et comprendre l'histoire évolutive de la résistance (génétique des populations et génétique quantitative). 

expérimentations en champs et en conditions contrôlées, quelques déplacements en véhicule à prévoir. Permis de conduire recommandé.

Formations et compétences recherchées

• Formation recommandée : une thèse en génétique quantitative de la résistance à une pression biotique. 
• Connaissances souhaitées : bioinformatique et SNP calling. 
• Expérience appréciée : une expérience en génétique des Brassica sera appréciée. 
• Aptitudes recherchées : maîtrise des langages R et/ou bash, capacité d'analyse en génétique quantitative. 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation