Offre de stage MASTER 2 : l'ADN environnemental pour la prévision du risque taupin (Agriotes spp.) par PCR digitale

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

L’ADN environnemental (ADNe) est une approche récente en écologie qui permet la détection et l’identification d’espèces à partir d’échantillons environnementaux (eau, sol, air, etc.). Si l’ADNe se prête bien aux environnements aquatiques, son application dans les milieux terrestres est plus complexe. Le sol présente des défis spécifiques comme la présence d’inhibiteurs de PCR.

Les dégâts dus aux larves de taupins sont devenus, depuis quelques années, une préoccupation majeure du monde agricole et ce, pour de nombreuses cultures. Ces ravageurs souterrains causent notamment des dégâts importants sur cultures de pomme de terre, impactant a la fois les rendements et la qualité commerciale des tubercules. Sans solution curative, l'évaluation du risque est la première étape avant l’implantation d’une culture sensible. Les techniques d’échantillonnage actuellement utilisées pour évaluer le risque sont lourdes, chronophages et peu adaptées à une utilisation de routine.

La PCR digitale (dPCR), plus sensible et robuste que la qPCR pour l’analyse de sols, constitue une alternative innovante, sensible et robuste pour détecter et quantifier les bioagresseurs directement dans les sols. Le projet DIGISOL vise à renforcer le diagnostic des bioagresseurs telluriques grâce à la PCR digitale (dPCR). Porté par Terres Inovia et INRAE-IGEPP, ce projet apportera des outils fiables pour la gestion sanitaire des cultures et l’accompagnement du monde agricole.

• Objectifs du stage :

Formations et compétences recherchées

•  Compétences souhaitées :

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation