Ingénieur-e en traitement de données métabolomiques

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein de l’Unité de Nutrition Humaine (UNH), sur la plateforme d’exploration du métabolisme (PFEM), une infrastructure scientifique collective de l’INRAE, dont l’équipe MSM (Métabolisme et Spectrométrie de Masse) est dédiée à la métabolomique.

L'intérêt principal de recherche de la PFEM concerne en particulier le développement de méthodes analytiques basées sur la spectrométrie de masse et d'outils bioinformatiques pour l'étude des relations entre nutrition et santé : profilage métabolique par des approches multiplateformes dans les biofluides et les tissus,  développement de stratégies analytiques pour l'identification de biomarqueurs à l'aide d'outils de spectrométrie de masse et bioinformatiques, développement de modèles et d'outils pour améliorer l'extraction de connaissances à partir de données de haut débit. La PFEM est un des membres fondateurs de l'infrastructure d'avenir MetaboHUB.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Coordonner la mise en œuvre technique d'une stratégie de traitement des données de spectrométrie de masse haute résolution,
• Effectuer une revue de la littérature des solutions pour appréhender les stratégies d'extraction des données,
• Réaliser des tests pratiques pour évaluer l'efficacité de différents workflows dans le cadre d'analyses de matériels de référence,
• Déterminer des stratégies optimales d'extraction des données et déploiement dans le consortium (rédaction de documentation, formation des analystes).

Formations et compétences recherchées

• Formation recommandée : BAC +5
• Connaissances souhaitées : science métabolomique et spectrométrie de masse haute résolution
• Expérience appréciée : 3 ans en spectrométrie de masse et/ou en métabolomique
• Aptitudes recherchées : Autonomie, organisation, motivation à travailler dans une équipe multidisciplinaire

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Le site de Theix situé à Saint-Genès-Champanelle est desservi par deux navettes dédiées aux agents INRAE qui relient le site à l'agglomération clermontoise, matin et soir, ainsi qu’une ligne de transport à la demande, il est également équipé de stationnements et de services dédiés à la pratique du vélo.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation