Stage : Révision des conditions de référence poissons du bioindicateur ELFI dans les estuaires français

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de l’UR 1454 Ecosystèmes Aquatiques et Changement Globaux  EABX– Centre INRAE, Nouvelle-Aquitaine -Cestas

Contexte :

Au cours de la dernière décennie, de 2015 à 2024, chaque année a été la plus chaude jamais enregistrée depuis 1850. De plus en plus d'éléments indiquent que le réchauffement climatique modifie considérablement la biodiversité à différents niveaux écologiques. Au niveau des communautés, le changement climatique provoque des extinctions locales, des invasions d'espèces et des changements dans l'abondance relative des espèces, ce qui conduit souvent à des communautés dominées par des espèces qui prospèrent dans des conditions plus chaudes. Cette tendance est depuis longtemps associée à l'expansion des espèces tropicales et subtropicales vers les pôles.

L'augmentation de la température de l'air déclenche également plusieurs autres changements abiotiques dans les milieux aquatiques, tels que l'augmentation de la température de l'eau, la réduction de l'oxygène dissous, la diminution du débit d'eau et la fréquence accrue des événements extrêmes. Aux fins de la directive-cadre sur l'eau (DCE), ces effets du changement climatique auront également une incidence sur ce que l'on appelle les conditions de référence pour plusieurs groupes taxonomiques. Les poissons des estuaires font partie de ces groupes surveillés dans le cadre de la DCE qui sont affectés par le changement climatique.

Les séries chronologiques relatives à l'abondance des poissons provenant de 10 systèmes estuariens du nord-est de l'Atlantique européen, du Portugal au Royaume-Uni, ont été analysées à l'aide d'un indice de température communautaire (CTI). Nos résultats révèlent une réorganisation générale des communautés de poissons estuariens, avec une prédominance croissante des espèces thermophiles. Cette tendance est plus marquée aux latitudes moyennes. Dans l'ensemble, la tropicalisation est la tendance dominante, mais cette trajectoire semble se dérouler en phases distinctes qui varient selon la latitude et l'écorégion. Les communautés des estuaires portugais restent relativement stables, ce qui suggère que le golfe de Gascogne pourrait être une zone de transition. À l'inverse, les estuaires nordiques montrent des signes de déborealisation, qui pourraient représenter un stade précoce de la restructuration des communautés sous l'effet du climat (Lobry et al., soumis). Dans ce contexte, il est nécessaire de réviser les conditions de référence pour les poissons dans les estuaires pour tenir compte des effets du changement climatique.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

A partir d’une série chronologique de suivi des communautés de poissons dans les estuaires, le travail du/de la stagiaire consistera à vérifier si les conditions de références établis il y a vingt ans à partir de données modélisées sont toujours valides à ce jour, où si des modifications (évolution) des communautés en lien avec le changement climatique sont perceptibles et nécessitent des ajustements et un recalcul des conditions de référence sur un jeu de données plus récent. Ce travail sera effectué à partir de modélisation statistique (GLMM, GAMM). L’impact des pressions anthropiques reste déterminant dans l’évaluation de la qualité écologique des masses d’eau mais un effet de dégradation semble perceptible sans pour autant qu’il y ait une augmentation des pressions. Un effet synergétique des pressions et de la température ? Les possibles interactions seront à explorer pour mieux comprendre les résultats actuels. Le stage est soutenu par les Agences de l’eau des façades maritimes et par le Ministère de la Transition écologique, de la Biodiversité et des Négociations internationales sur le climat et la nature.

Le stage comporte essentiellement de l’analyse de données et représente un beau défi pour apporter des éléments probants nécessaires pour la mise en œuvre des outils d’évaluation de la DCE et pour discuter avec la commission européenne de la nécessaire révision des conditions de référence poisson dans les eaux de transition.

Formations et compétences recherchées

Formation de Master 2 en écologie aquatique ou domaine similaire

Connaissances souhaitées : Bonne connaissance en traitement de données, statistique, logiciel R et bonne capacité rédactionnelle.

Expérience appréciée : Une première expérience de la bioindication serait un plus

Aptitudes recherchées : Bonne capacité de travail en équipe mais aussi une capacité à se saisir du sujet pour être force de proposition le cas échéant. 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  2.5 jours de congés/mois de présence effective
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective ;

-d'une prise en charge partielle abonnement domicile/travail (TER, TBM).

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation