Assistant.e Ingénieur.e sur Plateforme Génomique

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Ce recrutement intervient dans le cadre d'un contrat à durée indéterminée de mission scientifique, la date de fin dépendra de l'accomplissement du projet de recherche. 

Vous exercerez votre activité au sein de L'Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales sur la Plateforme de Séquençage et de Génotypage à haut débit Gentyane, ISC INRAE, labelisée IBISA, membre des infrastructures nationales INRAE Genomics et France génomique. Gentyane réalise plus de 100 projets annuels à destination de partenaires académiques et socio-économiques et sur une grande diversité d’espèces (animales et végétales). Le recrutement se fera sur le grade d’Assistant Ingénieur, sous la responsabilité de Charles PONCET, responsable de la Plateforme.

Votre mission consistera à la réalisation opérationnelle de l'ensemble des projets de génotypage, notamment de la technologie AgriSeq (tGBS), mais aussi d’autres technologies à disposition (chimie Kaspar sur LightCycler 480, Fluidigm Biomark, de SNP ultra-haut débit Axiom Thermo sur GeneTitan) et à venir, permettant la caractérisation fine de la diversité génétique (végétale et animale) par génotypage, c’est-à-dire la caractérisation de milliers de régions génomiques (ou SNP) ciblées (par amplification ou hybridation).

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1. Génotypage par séquençage de régions ciblées AgriSeq Thermo
2. Séquençage Aviti Element Biosciences
3. Génotypage sur puces microfluidiques (Fluidigm)

Certaines manipulations peuvent demander à travailler sur une amplitude horaire supérieure ou en décalé.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : DEUG, BTS, DUT, DEUST, en biotechnologie, Master

Connaissances souhaitées :

• Connaissance générale de la biologie
• Connaissance générale des concepts et techniques de biologie moléculaire

Expériences requises :

• Maîtriser les techniques de biologie moléculaire et avoir une expérience significative en génotypage par séquençage tGBS AgriSeq, en séquençage NGS sur Aviti Element Biosciences
• Connaître les principes d'utilisation et savoir utiliser des appareils spécifiques du domaine : séquenceurs, PCR, PCR temps réel…
• Utiliser les outils informatiques d'enregistrement, de stockage et d’analyse des données, et de pilotage des équipements
• Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteur.trice.s internes ou externes
• Rédiger des procédures techniques

Aptitudes recherchées :

• Autonomie, rigueur, sens de l'organisation, motivation, capacité d'initiative, bon relationnel, goût pour le travail en équipe
• Anglais : compréhension orale : niveau I, compréhension écrite : niveau II

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) ;
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Le site de Crouël est directement desservi par les lignes de bus régulières T2C n°9, n°35 et n°36.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation