Rôle de l’hydrodynamisme dans le déplacement et l’accumulation des communautés phytoplanctoniques d’un plan d’eau peu profond

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’Unité EABX du Centre INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux. Les recherches conduites par cette unité consistent à surveiller l’évolution de l’état écologique des écosystèmes aquatiques sous diverses catégories de pressions anthropiques et à comprendre l’impact des changements globaux sur la biodiversité aquatique à différents niveaux d’intégration biologique. L’Unité de Recherche mène des recherches sur différents types d’hydrosystèmes (cours d’eau, plans d’eau, systèmes estuariens et de transition) et sur différents types de communautés animales ou végétales. Le stage sera plus précisément centré sur les macrophytes aquatiques et les diatomées des plans d’eau.

Depuis plusieurs années, l’étang de Léon (Landes) est sujet à des proliférations de cyanobactéries qui ont des conséquences sanitaires et économiques importantes pour les communes riveraines. Ces proliférations conduisent à l’arrêt des activités aquatiques sur le plan d’eau et menacent la sécurité sanitaire des usagers. L’objectif du projet Léon Bloom piloté par l’unité EABX à INRAE, est d’étudier plusieurs axes de réflexion pour mieux comprendre l’origine de ces proliférations. Ce projet s’intéresse notamment à l’analyse du rôle des conditions hydrodynamiques sur la répartition spatiale des communautés phytoplanctoniques dans le plan d’eau.

L’action du vent et des vagues peut en effet contribuer à la distribution spatiale des communautés phytoplanctoniques dans cet étang dont la superficie dépasse  300 hectares. L’accumulation locale de cyanobactéries près des zones littorales ou, a contrario, la dispersion de leurs efflorescences peuvent être induites par l’intensité de l’hydrodynamisme. De plus, le vent et les vagues peuvent entraîner la remise en suspension des sédiments et favoriser la remobilisation des nutriments favorable au développement de ces efflorescences. Il est donc nécessaire d’évaluer spatialement l’intensité de l’hydrodynamique locale et d’analyser ses effets sur la distribution spatiale et l’abondance des cyanobactéries. Pour cela, de nombreuses méthodes sont disponibles (e.g. Keddy index, Wind Fetch Model) mais doivent être parfois adaptées au contexte particulier des plans d’eau d’eau douce peu profonds. Des modèles hydrodynamiques ont fait récemment l’objet d’applications en milieu marin et pourraient être appliqués en milieux continentaux dulçaquicoles.

L'objectif du stage est de contribuer à évaluer le rôle du vent et des vagues sur la remise en suspension des sédiments dans l’eau de l’étang de Léon, et sur l’accumulation des cyanobactéries à proximité de certaines rives. Il s’agira notamment de sélectionner et appliquer les méthodes pertinentes visant à caractériser spatialement et temporellement les effets du vent et des vagues sur les cyanobactéries. Pour cela, le stage s’appuiera sur des mesures in situ des différents groupes algaux et sur des données environnementales (e.g. vent, température et oxygène) acquises en 2024, 2025 et 2026 au niveau de plusieurs stations réparties sur le plan d’eau.

Le/la stagiaire devra :

- réaliser un travail bibliographique concernant le rôle du l’hydrodynamique sur la distribution et l’abondance du phytoplancton, notamment les cyanobactéries ;

- réaliser une recherche et une sélection des méthodes disponibles et des modèles pertinents pour calculer l’intensité de l’hydrodynamique en surface et au fond des plans d’eau. Le cas échéant, des adaptations des méthodes existantes au contexte particulier des étangs peu profonds seront à proposer et à valider ;

- appliquer la/les méthode(s) sur le jeu de données de terrain de l’étang de Léon et évaluer statistiquement les relations entre l’intensité de l’hydrodynamique et les variations spatiales et temporelles observées chez les communautés phytoplanctoniques du plan d’eau ;

- fournir une interprétation écologique des processus identifiés et rédiger un rapport final incluant la description détaillée des méthodes utilisées.

Il est également envisagé que le/la stagiaire participe aux campagnes prévues  jusqu’en avril 2026 sur le terrain.

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Étudiant(e) en Master 2 ou École d’Ingénieur, orienté(e) écologie des communautés.

Un intérêt et une motivation pour la mise en forme et le traitement des données seront très appréciés.

 Le (la) stagiaire doit être capable de :

- réaliser des modèles statistiques à l’aide du logiciel R (GAM, ARIMA, ARIMAX);

- réaliser des cartographies et des calculs SIG ;

- rédiger de documents (rapports, présentations orales) ;

- travailler de manière autonome et en équipe.

Un intérêt à participer aux campagnes de terrain sera également apprécié. 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation