Ingénieur-e en Microbiologie et Biologie moléculaire

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli(e) au sein de l’UMR1436 INRAE/ENVT INTHERES située sur le site de l’Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse. Cette unité de recherche, composée d’une quarantaine d’agents, est dédiée à la recherche sur les innovations thérapeutiques pour la réduction et l’optimisation des usages des antibiotiques et des antiparasitaires.

Vous travaillerez au sein d’un nouvelle équipe thématique « Dynamique des génomes et antibiorésistance » dans le cadre d’un projet ANR « STABLY » qui vise à comprendre les mécanismes responsables de la persistance des plasmides de résistance aux antibiotiques chez Staphylococcus aureus et à évaluer l'impact des conditions environnementales favorisant ou non cette persistance. À travers des expériences évolutives, des analyses microbiologiques, génomiques, transcriptomiques et microscopiques, le projet a pour but d’explorer la propagation des plasmides, leur coût pour l'hôte et leur maintien dans divers environnements non sélectifs ou sélectifs.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Construire des plasmides taggués avec des marqueurs florescent de type GFP
• Mener diverses expériences d’évolution bactérienne dans différents environnements (biofilm, cultures cellulaires, explants de peau ; hollow fiber..) et mettre au point les modèles en amont
• Analyser les plasmides et leur hôte au cours des expériences par diverses approches : dénombrement microbiologique, cytométrie de flux, qPCR, RT-qPCR, séquençage, microscopie...
• Traiter les données obtenues avec divers outils bio-informatiques
• Synthétiser et présenter les résultats lors des réunions du projet
• Participer à la valorisation des résultats (posters, rédaction d’articles).
• Eventuellement co-encadrer des étudiant de Master.

- Variabilité éventuelle des horaires de travail

-  Travail ponctuel le WE (lors des expériences d’évolution)

-  Travail en Laboratoire L2 _ L2 OGM

Formations et compétences recherchées

Formation recommandée : Diplôme Master2/ingénieur avec une spécialité microbiologie, biologie moléculaire

Connaissances souhaitées : Techniques de Microbiologie (dénombrement, travail en condition stérile, mesure de CMI...), de Biologie moléculaire (purification ADN, PCR, clonage…)

Expérience appréciée :  Analyses en cytométrie de flux, PCR quantitative, analyses bioinformatiques

Aptitudes recherchées :

- Rigueur, capacité d’organisation

- Capacité à travailler en autonomie et à gérer un projet.

-  Capacité à travailler en équipe et en collaboration

- Capacité à synthétiser ses résultats et les présenter en réunion de projet.

- Mise en forme des résultats obtenus et aide à la rédaction d’articles

- Maîtrise de l’anglais technique et scientifique.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation