Evaluer le rôle des pratiques de gestion des effluents et déchets organiques sur la fertilité des sols en agriculture biologique à travers la modélisation des flux de nutriments

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Grâce à ce leadership international, l’Institut peut contribuer à explorer les solutions devenues indispensables pour faire face aux défis mondiaux de ce siècle, en particulier sur le climat, la biodiversité et la sécurité alimentaire. Au sein d’INRAE, l’unité de recherche Sol, Agro et Hydrosystème, Spatialisation (UMR SAS ; INRAE, Institut Agro – Rennes) travaille sur les interactions entre agriculture et environnement, depuis l’échelle de la parcelle ou du bâtiment d’élevage jusqu’à celle du bassin versant ou de paysages agricoles. Elle étudie les systèmes de polyculture élevage du Grand-Ouest et a des compétences en agronomie, science du sol, hydrologie, bioclimatologie, géomatique et évaluation environnementale. Elle comprend environ 70 agents permanents, une quinzaine de doctorants et une trentaine d’agents non titulaires.

Environnement de travail, missions et activités

En France, et plus généralement en Europe, le développement de l’agriculture biologique (AB) est devenu une préoccupation majeure des pouvoirs publics dans le but de réduire les impacts environnementaux de la production alimentaire et de contribuer à l’atteinte des objectifs mondiaux en matière de climat et de biodiversité. Les politiques publiques nationales et européennes affichent ainsi des objectifs d’expansion de l’AB allant de 18 à 25% de la surface agricole utile contre environ 10% actuellement.

En parallèle de ces politiques publiques favorables à l’expansion de l’AB, la capacité de l’AB à nourrir la population mondiale est régulièrement questionnée, notamment en raison de ses rendements des cultures 20 à 25% inférieurs à ceux de l'agriculture conventionnelle (AC). Plusieurs études montrent que la carence en azote (N), élément essentiel pour la croissance des plantes, est le principal facteur limitant ces rendements. Selon des études récentes, si l’AB devait se développer de manière importante, cette carence pourrait s’aggraver du fait de sa dépendance à l’AC pour la fertilisation azoté des sols.

Face à cette dépendance et dans l’objectif de faciliter l’expansion de l’AB, la maitrise de la fertilité des sols apparait comme un pilier essentiel à l’AB et la gestion des effluents et déchets organiques est une clé de voute de cette fertilité. Toutefois, en AB, les pratiques de gestion de ces effluents et déchets organiques et les flux de nutriments associés sont peu documentés, notamment en lien avec les pratiques de gestion mis en œuvre récemment ou encore au stade d’innovation telles que la méthanisation ou la fermentation lactique.

Dans ce cadre, le projet ABMC financé par l’ADEME coordonné par INRAE en partenariat avec Agrobio35, Civam Bio 53 et AILE a pour objectif de faire le lien entre les pratiques et les modes de gestion des effluents et déchets organiques et la fertilité des sols en AB. Pour cela, une quarantaine d’exploitations AB du Grand-Ouest et d’Ile de France en polyculture-élevage, grande culture et maraichage sont enquêtées.

A partir des résultats de ces enquêtes qui seront disponibles en début de stage, l’objectif principal est de réaliser le traitement, l’analyse et la synthèse des données récoltées lors de ces enquêtes concernant les flux de nutriments au sein des exploitations. Pour cela, les principales missions de ce stage seront :

• Saisie et mise en forme des données récoltées
• Vérification et consolidation des données par analyse de la cohérence avec les références techniques et bibliographiques disponibles
• Modélisation des flux de nutriments (N&P) à l’échelle des exploitations à partir des données consolidées et de modèles de flux existants
• Identification de données ou références techniques manquantes et recherche bibliographique pour combler ces manques et pour définir les indicateurs pertinents
• Evaluation des liens entre pratiques, notamment de gestion des effluents et déchets organiques, et performances par analyse multivariée des données
• Partage et discussion des résultats avec les partenaires du projet
• Développement et réalisation d’un rendu pédagogique des résultats auprès des agriculteurs enquêtés

Pour réaliser ces missions, vous serez acueilli(e) au sein de l’UMR SAS dans le cadre du projet de recherche ABMC. Ce travail sera réalisé en collaboration avec les partenaires du projet : UR OPAALE, UMR ECOSYS, UMR SMART, Agrobio35, Civam Bio 53 et AILE.

Le stage se déroulera sur 6 mois entre février 2026 et septembre 2026

Formations et compétences recherchées

Étudiant.e ingénieur ou master 1 ou 2 en agronomie, agriculture ou agroécologie.

Avoir des connaissances en agronomie, sciences du sol, fertilisation, cycle de l’azote et analyse multivariée des données.

Etre organisé.e et méthodique avec des capacités de communication et de synthèse.

Autonomie, rigueur et aptitude au travail en équipe. Bon niveau en anglais.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation