Analyse génétique et interactions gènes x environnement du comportement alimentaire et des indicateurs de résilience chez les porcs en croissance

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Avec le changement climatique, améliorer la résistance au stress thermique est un enjeu majeur pour la production porcine dans de nombreux pays. De nouvelles stratégies sont nécessaires pour réduire l’impact du stress thermique sur les porcs ; l’une d’entre elles est la voie génétique qui vise à proposer des animaux mieux adaptés au stress thermique.

La solution génétique a été explorée dans le projet ANR PigHeat (2013-2016) qui visait à étudier la génétique de la tolérance à la chaleur chez les porcs en croissance. Ce projet a permis d’enregistrer des données de comportement alimentaire dans une population de porcs élevée dans 2 environnements contrastés (tempéré et tropical).

Environnement de travail, missions et activités

Les objectifs du stage sont :

1. Estimer les paramètres génétiques du comportement alimentaire et les corrélations entre les 2 environnements
2. Estimer les paramètres génétiques d’indicateurs de résilience basé sur les données longitudinales de comportement alimentaire
3. Etudier les interactions gènes x environnement (GxE) des indicateurs de résilience  

Cette étude permettra de mieux comprendre comment la tolérance à la chaleur se traduit en termes de comportement alimentaire et pourrait fournir des caractères à inclure dans la sélection pour la tolérance à la chaleur. De plus, l’étude des indicateurs de résilience dans 2 environnements contrastés est particulièrement pertinente pour intégrer ces caractères dans des schémas de sélection. 

Vous serez impliqué-e dans la modélisation des trajectoires des différents caractères de comportement alimentaire (ingéré, durée des repas, vitesse d’ingestion…) en utilisant des modèles de régression aléatoire. Les corrélations génétiques entre environnements et entre caractères seront ensuite estimées à partir de modèles multi-caractères. 
Dans un second temps, les analyses se concentreront sur la mesure d’indicateurs de résilience et l’estimation de leurs paramètres génétiques.

Le stage se déroulera sur le centre INRAE Antilles-Guyane, à l’Unité de Recherches AgroEcologie des SystèmesS d’Elevage Tropicaux (UR ASSET), situé au Domaine Duclos, Prise d’eau 97 170 Petit-Bourg Guadeloupe. Il sera encadré par N. POULLET (UR ASSET) et co-encadré par I. DAVID (UMR GenPhySE, INRAE Toulouse). 

Formations et compétences recherchées

• Disciplines : Agronomie, génétique, statistiques
• Compétences en analyse de données et statistiques (R)
• Compétences en génétique quantitative (ASReml)
• Esprit de synthèse, autonomie, sens de la rigueur 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation