Mission temporaire OT-22139

Ingénieur.e – traitement automatique pour des données de télédétection et textuelles

84000 Avignon

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Contexte

La Plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale (Plateforme ESV) est le premier réseau fondé par les plus grands acteurs français de la santé du végétal.

Elle a pour objectif d’améliorer la surveillance sanitaire et biologique du territoire face aux dangers sanitaires ou phénomènes phytosanitaires ayant ou pouvant avoir un impact sur l'état sanitaire des végétaux en France métropolitaine et les DROM. Pour ce faire, elle s’appuie sur les dernières avancées de la recherche.

Un des grands challenges de la surveillance en santé végétale est de prendre en compte de nombreux dangers sanitaires pesant sur de nombreuses espèces hôtes et d’immenses espaces géographiques, et ce de manière à détecter le plus précocement possible les désordres sanitaires ou évaluer le plus précisément possible l’état sanitaire du territoire. Actuellement, la Plateforme ESV utilise des méthodes basées sur des données de terrain, des évaluations du risque et la veille sanitaire médiatico-scientifique pour prioriser les bioagresseurs et les zones à surveiller. Dans cette optique, de nouvelles méthodes utilisant des données de télédétection (images, satellites, drones, avions) ou des données textuelles (littérature grise, réseaux sociaux, sources officielles, littérature scientifique) sont développées par des équipes de recherche et pourraient permettre d’élargir le spectre de la surveillance en santé végétale.

Ainsi, la Plateforme ESV vise à mettre en place au sein de son Système d’Information (SI) des méthodes et des outils permettant le traitement des données de télédétection et d’améliorer le traitement des données textuelles. Ces méthodes devront apporter une plus-value directe pour la surveillance en France de certains organismes nuisibles tels que le nématode du pin, la Flavescence dorée ou Xylella fastidiosa, et pour la veille sanitaire internationale (VSI) d’autres organismes nuisibles tels que le Tomato Leaf Curl New Delhi Virus, Geosmithia morbida, ou encore Pityophthorus juglandis.

Pour chacun de ces cas d’étude, un comité de suivi sera créé avec des experts du domaine et des réunions seront programmées régulièrement selon les avancées des cas d’étude.

Missions et activités

Vous intégrerez l’équipe OPE de l’unité BioSP à INRAE (https://biosp.org), composée de 7 agents permanents, tous appartenant à l’équipe opérationnelle à INRAE de la Plateforme ESV (https://plateforme-esv.fr). De plus, vous bénéficierez d’un environnement de travail étendu en participant à certaines activités de la Plateforme ESV dans son ensemble, ainsi qu’à certaines réunions des projets BEYOND et IMPACT.

Votre mission principale sera de mettre en œuvre des algorithmes de traitement de données de télédétection et de données textuelles pour répondre aux objectifs d’amélioration (i) des dispositifs de surveillance d’organismes nuisibles traités par la plateforme (en priorité le nématode du pin) et (ii) de la VSI (afin d’accroître le nombre d’organismes traités). En particulier, des algorithmes d’apprentissage automatique supervisés et non supervisés (semi-profonds ou profonds) pourront être appliqués aux jeux de données existants.  Les cas d'études vous sont présentés dans l'annexe de cette offre.

Plus concrètement, vous serez amené.e à :

  • vous approprier les cadres d’étude de votre mission :
    • la surveillance des organismes nuisibles ;
    • la veille sanitaire internationale ;
    • certains des outils et méthodes déjà utilisés par la plateforme sur ces sujets ;
  • récupérer et vous approprier les données de surveillance, les données télédétection et celles de la VSI ;
  • entraîner et évaluer des modèles d’apprentissage automatique selon un protocole établi (expériences, critères d’évaluation...) pour chaque cas d’étude ;
  • mettre en production les modèles qui seront sélectionnés sur la base de leur performance dans le SI de la Plateforme ESV ;
  • proposer une méthodologie permettant de surveiller l’évolution des performances des modèles (définition d’indicateurs de performance et implémentation dans le SI) ;
  • proposer un protocole de ré-entrainement des modèles lorsque de nouvelles données sont disponibles. 

 

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Compétences recherchées

Savoir-faire :

  • Compétences nécessaires :
    • Machine learning et deep learning pour de la classification ou la régression
    • Maîtrise du langage python
    • Développement : algorithmique, tests
    • Connaissance de git
    • Test et benchmarking d’algorithmes d’IA
  • Compétences appréciées :
    • Connaissance de gitlab et jupyter notebook
    • Connaissance du langage R
    • Connaissance ou expérience dans le domaine de la télédétection ou traitement d’images
    • Connaissance ou expérience dans le domaine du traitement automatique de la langue naturelle 

Savoir-être :

  • Compétences nécessaires :
    • Être rigoureux, méthodique, savoir s’organiser et planifier son travail
    • Savoir communiquer et vulgariser auprès d’un public d’informaticiens et de non-informaticiens
    • Faire preuve d’initiative et être force de proposition
    • Savoir travailler en équipe
  • Compétences appréciées :
    • Être à l’aise en anglais
    • Être intéressé par (ou familier avec) le monde de la recherche
    • Avoir une appétence pour l’aspect opérationnel

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Nous réceptionnerons vos lettres de motivations et CV aux adresses mails de contacts indiqués jusqu à mi-juillet et les entretiens de recrutement auront lieu pendant la deuxième quinzaine de juillet

Annexe_CDD_traitement_automatique.pdfpdf - 49.58 KB

Référence de l'offre

  • Contrat : Mission temporaire
  • Durée : 18 mois
  • Début du contrat : 01/10/2024
  • Rémunération : 2 244.79€ Brut
  • N° de l'offre : OT-22139
  • Date limite : 15/07/2024
Le centre Provence-Alpes-Côte d’Azur

UMR 0546 BioSP 84000 Avignon

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