Stage de Master 1 - stage de césure : Contribuer à la mise au point et à l’utilisation d’un protocole de biologie moléculaire pour détecter la consommation de ravageurs clés en production de semences.

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet Agrosem2, porté par la FNAMS, dont l’objectif est de produire des semences (blé, luzerne, oignon, carotte, betterave sucrière, chanvre) sans recours aux produits phytosanitaires de synthèse, tout en respectant les critères de qualité des semences. Le projet repose sur la mise en place de stratégies agroécologiques combinant des leviers préventifs (rotations longues, bandes fleuries, choix variétal, décalage des dates d’implantation, semis sous couvert, gestion de la fertilisation) et, si nécessaire, des méthodes curatives alternatives (désherbage mécanique ou manuel, biocontrôle). Des essais expérimentaux sont conduits dans trois stations expérimentales de la FNAMS (Brain, Condom, Castelnaudary).
Le stage s’inscrira dans un volet du projet consacré à l’étude des interactions entre ravageurs et prédateurs généralistes dans les cultures de semences de luzerne (et carotte). Cette culture peut être fortement affectée par plusieurs ravageurs (tychius, phytonomes, cécidomyies, punaise miridae), et l’identification de leurs prédateurs naturels est essentielle pour renforcer les régulations biologiques.
Le travail portera principalement sur l’analyse des interactions trophiques entre ravageurs et prédateurs généralistes à l’aide d’outils moléculaires. Des analyses d’ADN seront réalisées à partir du contenu stomacal de prédateurs (araignées, carabes, punaises prédatrices) collectés dans les cultures afin de détecter la présence d’ADN de ravageurs consommés. Après extraction de l’ADN, des PCR multiplex permettront d’identifier plusieurs espèces de ravageurs au sein d’un même échantillon, y compris lorsque les proies ont été partiellement digérées.
Les prédateurs analysés proviendront d’échantillonnages réalisés à la surface du sol (pièges Barber) et dans la végétation (filet fauchoir) – avant la période de stage. Les données issues des analyses moléculaires permettront d’identifier les groupes de prédateurs impliqués dans la consommation des principaux ravageurs de la luzerne et d’évaluer leur rôle potentiel dans la régulation biologique. Ces résultats contribueront à mieux comprendre les réseaux trophiques dans les cultures de semences et à orienter la conception de systèmes de culture favorisant ces auxiliaires de cultures. 

Objectifs du stage :
Le stage a pour objectif d’identifier les auxiliaires susceptibles de contribuer à la régulation biologique des ravageurs, en caractérisant les interactions trophiques entre ravageurs et prédateurs généralistes dans les cultures de semences de luzerne. Le stagiaire viendra en appui aux travaux conduits par Ségolène Buzy, assistante ingénieure dans le projet Agrosem2, notamment sur la mise en oeuvre d’analyses moléculaires (mise au point et analyse des échantillons) permettant de détecter la consommation de ravageurs par les prédateurs.

Missions du stagiaire :
• Principales : Développement et mise en oeuvre d’une PCR multiplex ciblant les ravageurs d’intérêt, incluant la validation des amorces (tests de sensibilité et de spécificité, si non terminés), puis la réalisation des analyses moléculaires (extraction d’ADN, PCR multiplex, électrophorèse) sur les échantillons issus de la campagne de terrain 2026.
• Secondaires : Identification des communautés de prédateurs présentes sur les différents sites à partir des échantillons collectés par la FNAMS.

Formations et compétences recherchées

Niveau : Master 1 : Formations en biologie, biologie moléculaire et entomologie sont attendues

Profil requis
• Intérêt pour l’expérimentation en laboratoire et la mise au point de dispositifs d’étude.
• Expérience et connaissances en biologie moléculaire (extraction d’ADN, PCR multiplex, électrophorèse) et en entomologie.
• Grande rigueur, autonomie et sens du relationnel.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation