Post-doctorat (36 mois) en myogenèse : Signature moléculaire de la niche des cellules souches musculaires

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Présentation du projet

La plupart des poissons présentent une croissance musculaire post-larvaire continue, caractérisée par la formation persistante de nouvelles fibres musculaires à partir de cellules souches musculaires (cellules satellites) après l’éclosion. Cependant, après la phase de croissance hyperplasique, le nombre de cellules souches ainsi que la fonctionnalité de leur niche diminuent fortement, même si la croissance se poursuit.

Deux laboratoires de recherche partenaires reconnus pour leurs travaux en myogenèse et sur les cellules souches, à savoir l’UR LPGP et l’UMR PAnTher, ont récemment obtenu un financement (via l’ANR) pour la mise en œuvre d’un projet intitulé « AMuFish ». Ce projet vise à élucider les mécanismes cellulaires et moléculaires responsables du déclin de la fonctionnalité de la niche des cellules souches musculaires chez la truite. Pour atteindre cet objectif, nous étudierons : (i) l’évolution du transcriptome des noyaux des fibres musculaires, (ii) le rôle respectif du poids et de l’âge des truites, et (iii) la manière dont le déclin de la fonctionnalité de la niche module le comportement des cellules souches musculaires.

Responsabilités principales du chercheur post-doctorant

• La personne recrutée sera chargée de concevoir et de conduire des expériences in vivo et in vitro permettant de mieux comprendre la niche des cellules souches musculaires.
• Elle/Il réalisera l’analyse bioinformatique des ensembles de données RNAseq.
• Elle/Il travaillera sous la double supervision de Jean-Charles Gabillard (responsable du projet) et de Karl Rouger (partenaire du projet), et interagira avec les autres membres des deux unités de recherche.

Activités principales

• Définir le plan d’étude et de collecte des données à mettre en œuvre afin de fournir des informations sur le snRNAseq et les principales caractéristiques de la niche des cellules souches pour répondre aux questions biologiques.
• Fournir un retour aux partenaires sur le potentiel et les limites des approches et organiser un suivi de l’avancement technique.
• Traiter les données par leur analyse, interprétation et validation des résultats.
• Diffuser et valoriser les résultats et les avancées technologiques.
• Appliquer les règles d’hygiène et de sécurité sur le terrain.

Localisation

Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons, Rennes, FRANCE (principal).

Unité de Pathophysiologie Animale et Biothérapie des maladies musculaires et du système nerveux, Nantes, FRANCE (secondaire).

Formations et compétences recherchées

Profil du candidat

• Doctorat (PhD) en biologie cellulaire, biologie moléculaire ou domaine connexe.
• Candidat très motivé, curieux et enthousiaste, titulaire d’un doctorat en myogenèse, avec un fort intérêt pour la biologie cellulaire et la croissance musculaire.
• Une expérience préalable dans l’étude des tissus musculaires sera appréciée.
• Compétences scientifiques et méthodologiques.
• Expertise en biologie musculaire.
• Expérience en analyses RNAseq sur cellules et/ou noyaux uniques.

Compétences

• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats.
• Utiliser les outils informatiques et logiciels spécifiques à l’activité.
• Capacité à communiquer à l’oral et à l’écrit auprès de différents publics.
• Compétences comportementales.
• Autonomie, esprit d’initiative et sens de l’organisation.
• Rigueur scientifique et esprit critique.
• Capacité d’analyse et de planification des tâches.
• Aptitude au travail en équipe (compétences relationnelles).

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation