Caractérisation de la variabilité génétique des réponses d’un panel de diversité de lignées de blé tendre à des ressources en eau limitantes. Méthodologies de Phénotypage au champ

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Missions

Vous serez en charge du suivi d’un essai analytique en plein champ avec des variétés de blé tendre ainsi que de l’acquisition de données phénotypiques et environnementales, et de l’analyse des résultats.

Contexte

Le changement climatique entraine un dérèglement des normales saisonnières au niveau température et pluviométrie pouvant impacter la disponibilité en éléments nutritifs. Le choix de variétés adaptées à ces stress abiotiques est un des leviers utilisables pour maintenir le potentiel agronomique. Se mettre en capacité d’identifier ce type de ressources nécessite, d’une part, de caractériser la variabilité disponible au sein du pool cultivé et, d’autre part, d’identifier les mécanismes sous-jacents à cette adaptation.

Au sein de l’unité expérimentale DiaScope (INRAe), la plateforme de phénotypage haut débit DiaPhen met en œuvre des techniques et méthodologies innovantes de caractérisation des plantes et de l’environnement grâce à des outils et des méthodes développées au sein de l’infrastructure de recherche PHENOME-EMPHASIS.

Ce stage sera encadré par Aline Rocher (aline.rocher@inrae.fr) sous la responsabilité d’Antonin Grau (antonin.grau@inrae.fr), ingénieur responsable des expérimentations céréales à paille.

Le projet européen PHENET - Tools and methods for extended plant PHENotyping and EnviroTyping services of European Research Infrastructures - propose de caractériser le potentiel d’adaptation d’un panel de génotypes de blé tendre face aux stress abiotiques, afin de développer ensuite des outils permettant d’identifier les stratégies les plus performantes au niveau agronomique et donc d’accélérer la transition agro-écologique. Une clé à ce projet est le phénotypage in situ de collections de matériel génétique sous diverses combinaisons de stress au sein d’un réseau d’essai (Europe), représentant un gradient climatique.

En 2026, la plateforme DiaPhen accueillera deux expérimentations du projet PHENET et déploiera des outils d’imagerie (SPAD, Caméras) à différentes échelles pour caractériser la réponse des plantes cultivées selon deux scénarios hydriques (optimum vs pluvial).

Activités

Concrètement, vous serez chargé de :

• Suivi d’un cycle cultural d’un panel de diversité de blé tendre (40 lignées) en conditions hydrique contrastées.
• Suivi de l’essai en termes de développement de la culture et d’état sanitaire des parcelles.
• Acquisition de données phénotypiques : réaliser les observations, les notations et les échantillonnages de terrain sur la base du protocole expérimental.
• Acquisition de données environnementales via l’utilisation de capteurs (tensiomètres, sondes capacitives, pluviomètres, etc…)
• Saisir, mettre en forme, archiver et traiter les données récoltées.
• Interpréter les résultats issus du traitement des données.
• Participer à l’élaboration d’un programme R type Rmarkdown pour visualiser et présenter les résultats (Optionnel).

L’essai sera également suivi en partie par les techniciens de la plateforme en charge des outils de phénotypage haut débit (drone et phénomobile) ainsi que la technicienne référente en agronomie des céréales.

Vous serez amené à participer au suivi d’autres essais sur céréales de façon à avoir une vue globale des activités en lien avec le phénotypage de plantes portées par l’UE DIASCOPE.

Possible travail en horaires décalés (début 7h).

Période de stage possible à partir de début Mars en fonction de la formation de l’étudiant.e.

Permis de conduire B et véhicule personnel très fortement recommandé.

Formations et compétences recherchées

Etudiant.e en BTS, BUT, Licence pro, Master 1 agronomie / expérimentation végétale.

Intérêt pour l’écophysiologie et le travail de terrain.

Goût pour l’analyse de données et notions de base en statistiques. 

Sensibilité pour les nouvelles technologies et la programmation informatique (langage R).

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

-  jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation